123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1657 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  70 
 
 		 221 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  69.55 
 
 		 221 aa  307  9e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  68.81 
 
 		 1020 aa  298  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  66.51 
 
 		 215 aa  295  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  70.44 
 
 		 209 aa  295  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  64.38 
 
 		 253 aa  294  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  71.98 
 
 		 220 aa  291  5e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  64.06 
 
 		 216 aa  283  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  68.12 
 
 		 222 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  63.46 
 
 		 214 aa  281  8.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  62.56 
 
 		 222 aa  280  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4835  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  69.31 
 
 		 224 aa  280  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0530651  normal  0.102652 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  63.33 
 
 		 215 aa  278  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4910  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  68.81 
 
 		 224 aa  277  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  64.59 
 
 		 216 aa  277  9e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  62.56 
 
 		 222 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2277  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  64.59 
 
 		 216 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  64.38 
 
 		 222 aa  272  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  61.29 
 
 		 216 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  61.9 
 
 		 214 aa  268  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  65.87 
 
 		 219 aa  267  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  65.38 
 
 		 219 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  65.38 
 
 		 219 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  65.38 
 
 		 219 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  60.93 
 
 		 215 aa  264  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  65.22 
 
 		 214 aa  264  8.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  62.44 
 
 		 221 aa  261  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  59.35 
 
 		 217 aa  237  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  55.67 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  55.67 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  55.67 
 
 		 253 aa  229  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00398  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  60.71 
 
 		 210 aa  224  7e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  52.94 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  52.94 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1533  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  55.22 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.5 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.83 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4413  hypothetical protein  34.17 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4231  hypothetical protein  29.44 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4254  hypothetical protein  28.5 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  40.54 
 
 		 167 aa  64.3  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.4 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  37.5 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.52 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  44.74 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0956  hypothetical protein  27.36 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  31.63 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  31.63 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.61 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.14 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2788  hypothetical protein  35.06 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  35.8 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1589  hypothetical protein  30.95 
 
 		 182 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0775913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  36.99 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0644  CzcN domain-containing protein  37.97 
 
 		 199 aa  52.4  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.193641  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.23 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.57 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.57 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4825  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.57 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.86 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.13 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.11 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1643  lipid A phosphate methyltransferase  34.15 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00799898  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.1 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.65 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.57 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.15 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  30.56 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.77 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7385  hypothetical protein  39.77 
 
 		 252 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.86 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.38 
 
 		 170 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.1 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.66 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.56 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.27 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  41.56 
 
 		 266 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.56 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.09 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1777  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.18 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.81 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  29.46 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.17 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.11 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.03 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.48 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  29.46 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  29.46 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3939  hypothetical protein  26.88 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  27.12 
 
 		 288 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.9 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  26.26 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12464  hypothetical protein  32.26 
 
 		 139 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.364998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0145  hypothetical protein  32.95 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4722  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.17 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.680037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3685  hypothetical protein  28.72 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.8 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>