82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1643 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1643  lipid A phosphate methyltransferase  100 
 
 
254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00799898  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.67 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.75 
 
 
204 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  29.75 
 
 
204 aa  62.8  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  29.75 
 
 
204 aa  62.8  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.94 
 
 
205 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0429  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  34.04 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4722  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.23 
 
 
185 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.680037 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  34.09 
 
 
273 aa  59.3  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.95 
 
 
284 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.96 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  30.36 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  30.36 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2817  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.16 
 
 
250 aa  55.8  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2346  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.6 
 
 
188 aa  55.8  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.44 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  38.71 
 
 
139 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.15 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.93 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
221 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.56 
 
 
226 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  33.33 
 
 
221 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4105  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.79 
 
 
206 aa  52.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.698715  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  52  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.26 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  34.15 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  34.15 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1015  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.48 
 
 
226 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0686836  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  34.94 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.44 
 
 
191 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  37.8 
 
 
167 aa  50.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  34.15 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  34.15 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  34.15 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.94 
 
 
216 aa  49.7  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.16 
 
 
191 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.18 
 
 
220 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  31.76 
 
 
214 aa  48.9  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  32.18 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30 
 
 
157 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  30 
 
 
193 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1583  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.43 
 
 
147 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  normal  0.610133 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0685  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.56 
 
 
147 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  31.71 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2905  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.41 
 
 
186 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429593  hitchhiker  0.00729038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.92 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4910  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.71 
 
 
224 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.49 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30 
 
 
187 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  39.24 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  31.03 
 
 
215 aa  46.6  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.03 
 
 
220 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0672  nickel-cobalt-cadmium resistance protein NCCN  29.55 
 
 
206 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.78 
 
 
166 aa  46.2  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0318  hypothetical protein  29.17 
 
 
168 aa  46.2  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0673382  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  37.35 
 
 
219 aa  45.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4050  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.78 
 
 
135 aa  45.8  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207243  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.52 
 
 
219 aa  45.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_86391  predicted protein  37.21 
 
 
196 aa  45.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  31.71 
 
 
1020 aa  45.4  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  29.41 
 
 
214 aa  45.4  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.12 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0241  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.25 
 
 
175 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9832  predicted protein  31.76 
 
 
187 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0410  hypothetical protein  34 
 
 
170 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.746594  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0484  hypothetical protein  35.29 
 
 
161 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.5 
 
 
158 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0644  CzcN domain-containing protein  33.33 
 
 
199 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.193641  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.76 
 
 
196 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  34.44 
 
 
137 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11240  integral membrane protein  32.31 
 
 
224 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000124394  normal  0.0612998 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.52 
 
 
219 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
170 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1579  hypothetical protein  33.65 
 
 
153 aa  42.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.77 
 
 
187 aa  43.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2780  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.37 
 
 
199 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0802217  hitchhiker  0.0000249152 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1884  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  31.65 
 
 
147 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.14 
 
 
227 aa  42.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  36.17 
 
 
153 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
219 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.56 
 
 
214 aa  42  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.33 
 
 
219 aa  42  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>