86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00359 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  100 
 
 
217 aa  443  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  74.3 
 
 
215 aa  341  5e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00398  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  75.76 
 
 
210 aa  298  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  61.57 
 
 
222 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  62.02 
 
 
222 aa  274  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  62.04 
 
 
216 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  63.29 
 
 
219 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  59.35 
 
 
216 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  61.17 
 
 
1020 aa  271  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  62.8 
 
 
219 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  62.8 
 
 
219 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  63.9 
 
 
215 aa  270  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  62.8 
 
 
219 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  60.58 
 
 
209 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  60.87 
 
 
216 aa  268  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  59.26 
 
 
222 aa  268  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2277  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  60.48 
 
 
216 aa  266  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  62.56 
 
 
221 aa  264  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  62.56 
 
 
221 aa  263  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  59.35 
 
 
220 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  59.35 
 
 
220 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  60.58 
 
 
215 aa  257  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  60.87 
 
 
214 aa  256  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  58.6 
 
 
221 aa  247  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  56.65 
 
 
253 aa  242  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  59.72 
 
 
220 aa  241  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  60.77 
 
 
214 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4910  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  58.02 
 
 
224 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1533  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  56.94 
 
 
218 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4835  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  59.26 
 
 
224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0530651  normal  0.102652 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  56.88 
 
 
222 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  51.89 
 
 
214 aa  227  9e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  51.21 
 
 
248 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  51.21 
 
 
248 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  50.24 
 
 
253 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  50.24 
 
 
253 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  50.24 
 
 
253 aa  218  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.42 
 
 
220 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.41 
 
 
219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4413  hypothetical protein  33.17 
 
 
216 aa  102  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.36 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.04 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4254  hypothetical protein  33.64 
 
 
177 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.43 
 
 
213 aa  51.6  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  36.9 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  34.94 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  32.53 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  35.9 
 
 
158 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4231  hypothetical protein  31.78 
 
 
177 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3689  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.43 
 
 
170 aa  48.9  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.699231  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0088  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.11 
 
 
202 aa  48.9  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.11 
 
 
196 aa  48.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.51 
 
 
219 aa  48.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.15 
 
 
284 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  24.68 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.81 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0660  hypothetical protein  35.71 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  31.76 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.44 
 
 
198 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.17 
 
 
189 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.85 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0956  hypothetical protein  30.95 
 
 
209 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.56 
 
 
206 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  29.55 
 
 
167 aa  46.2  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.05 
 
 
166 aa  45.4  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.52 
 
 
188 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3939  hypothetical protein  25.62 
 
 
200 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227544  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5364  hypothetical protein  31.96 
 
 
209 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865399  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0429  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  24.8 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4105  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.57 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.698715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  28.24 
 
 
157 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2482  hypothetical protein  34.12 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2788  hypothetical protein  28.75 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.21 
 
 
195 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.32 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_002950  PG1466  hypothetical protein  35.21 
 
 
190 aa  43.5  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  30.08 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  27.71 
 
 
153 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  25.42 
 
 
215 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1384  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  28.75 
 
 
133 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00401101  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.26 
 
 
219 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3040  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.94 
 
 
197 aa  42  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.41 
 
 
210 aa  42  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.61 
 
 
195 aa  42  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.25 
 
 
196 aa  42  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.95 
 
 
219 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>