74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60928 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_60928  predicted protein  100 
 
 
243 aa  495  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01050  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase, putative  30.64 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442432  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_86391  predicted protein  33.66 
 
 
196 aa  92.4  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9832  predicted protein  32 
 
 
187 aa  92  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06162  Prenylcystein carboxymethyl transferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI75]  38.81 
 
 
322 aa  88.2  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.423115  normal  0.603581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.29 
 
 
188 aa  72  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.15 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.43 
 
 
196 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  38.55 
 
 
194 aa  63.5  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  38.55 
 
 
194 aa  63.5  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.21 
 
 
195 aa  62  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.51 
 
 
214 aa  62  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.2 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.43 
 
 
189 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.43 
 
 
189 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.43 
 
 
189 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.43 
 
 
189 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2780  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.03 
 
 
199 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0802217  hitchhiker  0.0000249152 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.92 
 
 
219 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.99 
 
 
209 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.68 
 
 
195 aa  56.2  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.68 
 
 
194 aa  55.5  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0813  hypothetical protein  34.68 
 
 
170 aa  54.7  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.495338  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.08 
 
 
189 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0088  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.07 
 
 
202 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.23 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1797  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.77 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.31 
 
 
189 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.29 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5689  hypothetical protein  23.38 
 
 
198 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.414471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.59 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.35 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5322  hypothetical protein  23.38 
 
 
198 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.633891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.51 
 
 
159 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.25 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  30.16 
 
 
219 aa  53.9  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  34.43 
 
 
189 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.43 
 
 
189 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.17 
 
 
189 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3685  hypothetical protein  23.38 
 
 
207 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.78 
 
 
219 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.48 
 
 
219 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  36.36 
 
 
167 aa  52.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.41 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.83 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.69 
 
 
196 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.91 
 
 
162 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0537  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.79 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.386143 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.23 
 
 
187 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4825  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.61 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.61 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.61 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1692  hypothetical protein  31.73 
 
 
235 aa  48.9  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.06 
 
 
187 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.17 
 
 
196 aa  46.2  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.26 
 
 
207 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0524  hypothetical protein  34.52 
 
 
168 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3090  hypothetical protein  25.83 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.73 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.95 
 
 
160 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  30.91 
 
 
158 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  36.08 
 
 
153 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  24.11 
 
 
207 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0672  nickel-cobalt-cadmium resistance protein NCCN  27.42 
 
 
206 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3532  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.25 
 
 
193 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2501  hypothetical protein  35.71 
 
 
168 aa  42.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.92 
 
 
222 aa  42.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.05 
 
 
206 aa  42.7  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0193  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.66 
 
 
229 aa  42.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00375189  decreased coverage  0.000266905 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  34.07 
 
 
221 aa  42  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11951  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.64 
 
 
157 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0481851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  29.13 
 
 
186 aa  42  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.07 
 
 
157 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0358  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.06 
 
 
147 aa  42  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>