151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2503 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 
162 aa  319  8e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  46.41 
 
 
159 aa  137  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3532  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  47.71 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1657  hypothetical protein  37.97 
 
 
165 aa  105  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2501  hypothetical protein  38.22 
 
 
168 aa  102  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0524  hypothetical protein  36.97 
 
 
168 aa  97.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0461  hypothetical protein  37.8 
 
 
168 aa  93.6  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0483  hypothetical protein  32.93 
 
 
168 aa  90.9  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0528  hypothetical protein  36.65 
 
 
167 aa  89.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.94 
 
 
188 aa  85.1  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0252  hypothetical protein  39.2 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.329609  normal  0.630144 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  34.84 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09601  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.06 
 
 
190 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.326284 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.23 
 
 
189 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14761  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.66 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.579827  normal  0.674203 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0644  hypothetical protein  29.3 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11951  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  26.88 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0481851  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.58 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0653  hypothetical protein  33.99 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.734348  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  34.23 
 
 
207 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1115  hypothetical protein  35.23 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0000054458  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25 
 
 
212 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.94 
 
 
189 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.94 
 
 
189 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.6 
 
 
189 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.04 
 
 
189 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.05 
 
 
188 aa  60.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  36.47 
 
 
147 aa  60.5  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.91 
 
 
191 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.04 
 
 
189 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0743  hypothetical protein  35.42 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0551326  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3366  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.04 
 
 
189 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  29.66 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  32.74 
 
 
167 aa  57.8  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3140  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.93 
 
 
152 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0549373  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2487  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.04 
 
 
152 aa  57  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159987  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  27.78 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.82 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.26 
 
 
207 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3765  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.41 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.9 
 
 
202 aa  54.7  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2780  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.34 
 
 
199 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0802217  hitchhiker  0.0000249152 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.9 
 
 
139 aa  54.3  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.163139  normal  0.0635532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.73 
 
 
219 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12111  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.68 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.376517  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.51 
 
 
217 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0786  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.63 
 
 
221 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.93 
 
 
219 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.23 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60928  predicted protein  29.91 
 
 
243 aa  51.6  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2018  hypothetical protein  29.53 
 
 
172 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.568295  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.2 
 
 
214 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0506  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  39.33 
 
 
98 aa  50.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255044  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.91 
 
 
166 aa  50.8  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  32.74 
 
 
219 aa  50.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.2 
 
 
219 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.47 
 
 
224 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20970  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  31.67 
 
 
184 aa  50.4  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.43 
 
 
219 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.04 
 
 
219 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.82 
 
 
219 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.18 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.97 
 
 
219 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.86 
 
 
219 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1579  hypothetical protein  31.58 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0013  hypothetical protein  30.47 
 
 
225 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1463  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.63 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1162  hypothetical protein  30.47 
 
 
225 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1442  hypothetical protein  30.47 
 
 
225 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0016  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  30.47 
 
 
225 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0017  hypothetical protein  30.47 
 
 
225 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  32.1 
 
 
273 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.1 
 
 
284 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.71 
 
 
205 aa  48.5  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1432  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.11 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2990  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.13 
 
 
226 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1384  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  30.09 
 
 
133 aa  48.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00401101  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11240  integral membrane protein  29.84 
 
 
224 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000124394  normal  0.0612998 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4737  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.06 
 
 
196 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1520  hypothetical protein  29.69 
 
 
225 aa  47.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0739  hypothetical protein  30.77 
 
 
144 aa  47.8  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000109316  decreased coverage  0.00117402 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0636  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.14 
 
 
187 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000367771  unclonable  0.0000000000992166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2133  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.52 
 
 
148 aa  47.4  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.717642  hitchhiker  0.000108001 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.52 
 
 
213 aa  47.4  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.86 
 
 
219 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.86 
 
 
219 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  30.56 
 
 
258 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.71 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4825  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.86 
 
 
219 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2861  hypothetical protein  29.73 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1321  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.11 
 
 
239 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2218  protein of unknown function DUF1295  23.94 
 
 
219 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  0.0389914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  28.97 
 
 
186 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0015  hypothetical protein  30.95 
 
 
225 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.698874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  28.36 
 
 
256 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01050  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase, putative  26.98 
 
 
257 aa  45.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442432  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.26 
 
 
227 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0537  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29 
 
 
233 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.386143 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12464  hypothetical protein  29.91 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.364998  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>