99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0461 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0461  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  345  2e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2501  hypothetical protein  87.5 
 
 		 168 aa  285  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0524  hypothetical protein  66.47 
 
 		 168 aa  223  8e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1657  hypothetical protein  63.1 
 
 		 165 aa  214  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0483  hypothetical protein  58.06 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0528  hypothetical protein  66.1 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.24 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3532  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.25 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.8 
 
 		 162 aa  101  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  35.71 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0252  hypothetical protein  36.94 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.329609  normal  0.630144 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0653  hypothetical protein  45.57 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.734348  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11951  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  25.64 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0481851  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48233  predicted protein  35.54 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0415142  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1115  hypothetical protein  36.14 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0000054458  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.68 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12111  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.14 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.376517  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.94 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  29.73 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  35.14 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  37.37 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3765  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.3 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0743  hypothetical protein  39.13 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0551326  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14761  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.17 
 
 		 185 aa  62  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.579827  normal  0.674203 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0644  hypothetical protein  45.05 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09601  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.45 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.326284 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.31 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.71 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.14 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  36.71 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.14 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  27.74 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2018  hypothetical protein  40.45 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.568295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.35 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.35 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.53 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.42 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1463  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.38 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.35 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.35 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.05 
 
 		 221 aa  51.6  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3366  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.73 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0537  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.71 
 
 		 233 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.386143 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.17 
 
 		 139 aa  50.8  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.163139  normal  0.0635532 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.52 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.8 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1564  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60928  predicted protein  28.02 
 
 		 243 aa  49.7  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  35.8 
 
 		 196 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  36.36 
 
 		 245 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  31.25 
 
 		 207 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0506  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  36.62 
 
 		 98 aa  48.5  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  30.21 
 
 		 232 aa  48.5  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  44.3 
 
 		 193 aa  48.5  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1589  hypothetical protein  32.93 
 
 		 182 aa  47.8  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0775913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2133  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30 
 
 		 148 aa  47.4  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.717642  hitchhiker  0.000108001 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  22.54 
 
 		 256 aa  47.4  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2629  hypothetical protein  34.15 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  26.72 
 
 		 265 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  36.14 
 
 		 208 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  41.77 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0571  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.03 
 
 		 207 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.87 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4833  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.57 
 
 		 226 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1579  hypothetical protein  32.67 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0424  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.76 
 
 		 218 aa  44.7  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2219  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.26 
 
 		 225 aa  44.3  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0421811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0005  putative integral membrane protein  34.18 
 
 		 257 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.94 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.65 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20970  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  28.92 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0003  hypothetical protein  34.18 
 
 		 257 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2218  protein of unknown function DUF1295  29.49 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  0.0389914 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0429  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  34.57 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.17 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0644  CzcN domain-containing protein  30.86 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.193641  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.99 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  30.63 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5094  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.63 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  26.25 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.71 
 
 		 227 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.59 
 
 		 217 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35 
 
 		 215 aa  42  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.63 
 
 		 188 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.91 
 
 		 219 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2540  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  30.49 
 
 		 233 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_86391  predicted protein  35.29 
 
 		 196 aa  41.6  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3140  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.38 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0549373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1777  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2861  hypothetical protein  29.63 
 
 		 208 aa  41.6  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  29.33 
 
 		 153 aa  41.6  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11240  integral membrane protein  29.11 
 
 		 224 aa  41.2  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000124394  normal  0.0612998 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  34.57 
 
 		 197 aa  41.2  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.1 
 
 		 219 aa  41.2  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  30.77 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.1 
 
 		 230 aa  41.2  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25890  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  28.75 
 
 		 209 aa  40.8  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>