100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4833 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4833  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5094  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  61.95 
 
 		 225 aa  288  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  46.02 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0192  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  49.11 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.786397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0537  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.84 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.386143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  40.38 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3999  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.61 
 
 		 224 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4073  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.61 
 
 		 224 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2219  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.78 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0421811 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0730  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.91 
 
 		 236 aa  136  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.776939  hitchhiker  0.000590903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2709  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.44 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11240  integral membrane protein  34.1 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000124394  normal  0.0612998 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.84 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6241  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.3 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1520  hypothetical protein  31.74 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0017  hypothetical protein  31.74 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0016  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  31.74 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1162  hypothetical protein  31.74 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0013  hypothetical protein  31.74 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1442  hypothetical protein  31.74 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0015  hypothetical protein  30.41 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.698874  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0193  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.22 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00375189  decreased coverage  0.000266905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2639  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.64 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3090  hypothetical protein  32.54 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1695  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 		 227 aa  105  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.14174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1564  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.13 
 
 		 224 aa  98.2  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1692  hypothetical protein  32.46 
 
 		 235 aa  95.5  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1321  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.55 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20970  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  37.63 
 
 		 184 aa  93.6  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2029  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.47 
 
 		 161 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000425437  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0018  hypothetical protein  44.3 
 
 		 79 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294318  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.63 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1657  hypothetical protein  38.75 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0358  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.67 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2073  hypothetical protein  35.63 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  34.48 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.5 
 
 		 159 aa  52  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.17 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.36 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.87 
 
 		 188 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  34.52 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  35.23 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1952  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.68 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.97 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  35.66 
 
 		 137 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  38.75 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.75 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3532  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.51 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.75 
 
 		 162 aa  48.5  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.53 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.09 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.09 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2540  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  41.46 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.72 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.09 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48233  predicted protein  31.4 
 
 		 270 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0415142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  32.89 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  28.95 
 
 		 153 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4624  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.35 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213452  normal  0.986486 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0461  hypothetical protein  34.57 
 
 		 168 aa  46.2  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2780  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.33 
 
 		 199 aa  45.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0802217  hitchhiker  0.0000249152 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0524  hypothetical protein  32.1 
 
 		 168 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2871  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.56 
 
 		 195 aa  45.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  29.49 
 
 		 166 aa  45.4  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 		 189 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2501  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  45.4  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.84 
 
 		 218 aa  45.4  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.1 
 
 		 189 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.51 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.1 
 
 		 189 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.51 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.51 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.28 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.5 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.84 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.53 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  34.57 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0786  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.44 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11951  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.4 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0481851  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0017  hypothetical protein  24.14 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  31.76 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1589  hypothetical protein  29.07 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0775913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  28.78 
 
 		 167 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02064  hypothetical protein  30.69 
 
 		 153 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.23 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2133  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.5 
 
 		 148 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.717642  hitchhiker  0.000108001 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1380  hypothetical protein  40.48 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0411508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.76 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12111  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  26.67 
 
 		 157 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.376517  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0233  hypothetical protein  34.07 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0653  hypothetical protein  31.76 
 
 		 175 aa  42.4  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.734348  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0257  hypothetical protein  34.07 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  42.4  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.23 
 
 		 139 aa  42  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.163139  normal  0.0635532 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  35.63 
 
 		 222 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  25.33 
 
 		 157 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.78 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>