64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0730 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0730  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 
236 aa  471  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.776939  hitchhiker  0.000590903 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0537  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  40.85 
 
 
233 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.386143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2709  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.7 
 
 
235 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3215  hypothetical protein  35.68 
 
 
232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227676  normal  0.0561388 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5094  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.97 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.91 
 
 
224 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.843705 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1321  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.43 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4833  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.91 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4073  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.05 
 
 
224 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.222565  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3999  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.05 
 
 
224 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147768  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2564  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.12 
 
 
230 aa  121  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0192  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.86 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.786397  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0193  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00375189  decreased coverage  0.000266905 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1564  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.49 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6241  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.63 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3090  hypothetical protein  30.64 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2219  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.05 
 
 
225 aa  115  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0421811 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1695  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 
227 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.14174 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11240  integral membrane protein  34.26 
 
 
224 aa  113  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000124394  normal  0.0612998 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1692  hypothetical protein  35.21 
 
 
235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2639  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.64 
 
 
224 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0015  hypothetical protein  32.7 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.698874  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1442  hypothetical protein  29.73 
 
 
225 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0016  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  29.28 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0017  hypothetical protein  29.28 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2029  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  38.46 
 
 
161 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000425437  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0013  hypothetical protein  29.28 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1162  hypothetical protein  29.28 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1520  hypothetical protein  29.28 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20970  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  33.69 
 
 
184 aa  93.2  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0018  hypothetical protein  36.71 
 
 
79 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294318  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.82 
 
 
202 aa  57  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.37 
 
 
212 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.59 
 
 
209 aa  52.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4624  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.86 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213452  normal  0.986486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.8 
 
 
284 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6146  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0971  normal  0.0597032 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  34.57 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1380  hypothetical protein  34.91 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0411508  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.21 
 
 
159 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2540  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  33.73 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11951  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36 
 
 
157 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0481851  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1115  hypothetical protein  32.89 
 
 
157 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0000054458  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  31.63 
 
 
166 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.49 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.36 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0446  hypothetical protein  31.87 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.752234  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.94 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.57 
 
 
189 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.57 
 
 
189 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4722  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  34.88 
 
 
185 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.680037 
 
 
-
 
NC_002936  DET1378  hypothetical protein  24.26 
 
 
203 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.57 
 
 
189 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  34.78 
 
 
253 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  35.37 
 
 
167 aa  42  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.65 
 
 
189 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1159  hypothetical protein  25 
 
 
196 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.168863  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1169  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  32.93 
 
 
241 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1429  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  32.93 
 
 
241 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1515  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  32.93 
 
 
241 aa  41.6  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135527  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0412  hypothetical protein  32.93 
 
 
241 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0131  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.93 
 
 
230 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.28 
 
 
213 aa  41.6  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0653  hypothetical protein  34.09 
 
 
175 aa  41.6  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.734348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>