77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1839 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  100 
 
 
253 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  54 
 
 
265 aa  211  9e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  51.19 
 
 
297 aa  209  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  43.87 
 
 
258 aa  185  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  48.15 
 
 
273 aa  176  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  44.88 
 
 
267 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  44.35 
 
 
264 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  42.39 
 
 
263 aa  163  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  42.46 
 
 
256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  41.7 
 
 
258 aa  161  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  42.8 
 
 
264 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  42.91 
 
 
256 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  38.82 
 
 
261 aa  155  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  40.64 
 
 
260 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  37.55 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  37.8 
 
 
258 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  39.74 
 
 
293 aa  145  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  40.56 
 
 
262 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  38.55 
 
 
275 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  38.04 
 
 
258 aa  138  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  38.13 
 
 
267 aa  135  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  40.74 
 
 
265 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  38.04 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  36.19 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  36.22 
 
 
277 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  34.63 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  38.74 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  36.73 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  33.72 
 
 
289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  37.12 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  37.2 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  41.01 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  32.68 
 
 
288 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  38.11 
 
 
277 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  32.06 
 
 
293 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  32.06 
 
 
257 aa  99.4  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  33.86 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  37.85 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  37.85 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  37.85 
 
 
296 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  31.36 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  29.58 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  29.17 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  31.5 
 
 
274 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  31.11 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  30.39 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  32.54 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10452  transmembrane protein  37.75 
 
 
178 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  30.24 
 
 
208 aa  68.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  35.16 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2218  protein of unknown function DUF1295  28.49 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  0.0389914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  33.06 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.672197 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02404  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05810)  27.96 
 
 
397 aa  57.4  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809933 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0049  hypothetical protein  29.93 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.976461  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  36.13 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  30.4 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  27.37 
 
 
488 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3090  hypothetical protein  37.63 
 
 
232 aa  48.9  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  25.2 
 
 
188 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.63 
 
 
221 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47763  predicted protein  25.91 
 
 
311 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04556  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02670)  25.61 
 
 
359 aa  45.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.114313  normal  0.885943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10451  transmembrane protein  50 
 
 
62 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1321  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.53 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.29 
 
 
158 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0745  protein of unknown function DUF1295  26.92 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4624  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.53 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213452  normal  0.986486 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1455  steroid 5-alpha reductase-like  17.83 
 
 
205 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.15 
 
 
188 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15581  steroid 5-alpha reductase C-terminal domain-containing protein  17.83 
 
 
205 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15431  steroid 5-alpha reductase C-terminal domain-containing protein  18.6 
 
 
205 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5094  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.05 
 
 
225 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443323 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  28.99 
 
 
189 aa  42.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.99 
 
 
189 aa  42.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2564  hypothetical protein  34.88 
 
 
166 aa  42.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000314462  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45361  predicted protein  33.33 
 
 
331 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0730  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.78 
 
 
236 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.776939  hitchhiker  0.000590903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>