80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0560 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  516  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  54.85 
 
 		 269 aa  255  4e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  50.19 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  50.83 
 
 		 264 aa  218  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  49.43 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  50.2 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  45.04 
 
 		 264 aa  201  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  44.21 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  44.44 
 
 		 270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  46.15 
 
 		 275 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  43.39 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  47.57 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  38.97 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  39.42 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  40.34 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  42.63 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  39.69 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  40.31 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  40.07 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  41.26 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  41.67 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  36.3 
 
 		 271 aa  142  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  36.88 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  37.26 
 
 		 258 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  38.17 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  39.85 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  35.29 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  35.8 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  37.45 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  34.67 
 
 		 267 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  33.46 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  35.57 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  35.48 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10452  transmembrane protein  41.77 
 
 		 178 aa  106  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  39.06 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  33.33 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  33.95 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  32.69 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  32.84 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  32.84 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  37.21 
 
 		 288 aa  98.6  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  28.79 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  27.65 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  26.98 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  29.73 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  30.08 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  30.38 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  30.38 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  33.87 
 
 		 269 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  30.34 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  27.35 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  34.17 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  32.77 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0049  hypothetical protein  27.7 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.976461  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47763  predicted protein  24.13 
 
 		 311 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02404  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05810)  28.71 
 
 		 397 aa  53.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.809933 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2218  protein of unknown function DUF1295  31.34 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  0.0389914 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0528  hypothetical protein  29.2 
 
 		 167 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48600  predicted protein  24.35 
 
 		 451 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0524  hypothetical protein  25.21 
 
 		 168 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.87 
 
 		 188 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0743  hypothetical protein  32.58 
 
 		 156 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0551326  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2501  hypothetical protein  25 
 
 		 168 aa  46.2  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0483  hypothetical protein  30.89 
 
 		 168 aa  45.8  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2503  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.73 
 
 		 162 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30 
 
 		 166 aa  45.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10451  transmembrane protein  46.3 
 
 		 62 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04556  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02670)  24.49 
 
 		 359 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.114313  normal  0.885943 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2935  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.85 
 
 		 160 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1463  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  26.19 
 
 		 156 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  36.84 
 
 		 488 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1657  hypothetical protein  25.86 
 
 		 165 aa  42.7  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1112  hypothetical protein  25.83 
 
 		 147 aa  42.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1169  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  34.07 
 
 		 241 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0024  hypothetical protein  34.07 
 
 		 238 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1429  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  34.07 
 
 		 241 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1515  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  34.07 
 
 		 241 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135527  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0412  hypothetical protein  34.07 
 
 		 241 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.77 
 
 		 212 aa  42.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0131  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.07 
 
 		 230 aa  42  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>