57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01775 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  522  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  58.73 
 
 
261 aa  259  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  43.55 
 
 
258 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  42.91 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  39.15 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  44.14 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  41.27 
 
 
271 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  38.64 
 
 
274 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  38.35 
 
 
279 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  38.17 
 
 
275 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  40.89 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  37.4 
 
 
269 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  34.33 
 
 
258 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  43.83 
 
 
277 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  38.56 
 
 
264 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  38.66 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  37.04 
 
 
271 aa  123  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  32.95 
 
 
261 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  32.56 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  36.73 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  39.58 
 
 
256 aa  115  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  36.6 
 
 
275 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  33.2 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  32.55 
 
 
269 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  32.41 
 
 
261 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  33.61 
 
 
263 aa  106  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  36.48 
 
 
270 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  35.98 
 
 
267 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  33.07 
 
 
264 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  31.92 
 
 
263 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  35.98 
 
 
260 aa  99  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  33.07 
 
 
297 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  34.14 
 
 
256 aa  94  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  33.2 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  33.33 
 
 
289 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  31.85 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  29.39 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  34.11 
 
 
293 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02404  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05810)  30.58 
 
 
397 aa  89  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809933 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  32.41 
 
 
265 aa  89  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  33.9 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  33.82 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  30 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  31.86 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  31.1 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  31.16 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  31.16 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  31.47 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  27.86 
 
 
208 aa  53.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10452  transmembrane protein  32 
 
 
178 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0049  hypothetical protein  28.26 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.976461  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  31.18 
 
 
488 aa  48.9  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  30 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20970  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  30.56 
 
 
184 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2218  protein of unknown function DUF1295  24.83 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  0.0389914 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.71 
 
 
189 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>