65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1241 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  100 
 
 
263 aa  521  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  44.57 
 
 
261 aa  237  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  44.44 
 
 
264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  45.14 
 
 
258 aa  205  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  44.36 
 
 
256 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  41.86 
 
 
271 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  43.53 
 
 
264 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  42.91 
 
 
253 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  41.54 
 
 
267 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  42.21 
 
 
267 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  39.54 
 
 
258 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  43.62 
 
 
262 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  40.23 
 
 
270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  40.3 
 
 
269 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  44.63 
 
 
273 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  42.37 
 
 
275 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  42.47 
 
 
297 aa  168  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  40.55 
 
 
256 aa  165  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  40.25 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  40.34 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  42.91 
 
 
265 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  43.66 
 
 
265 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  37.12 
 
 
264 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  38.78 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  35.21 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  37.45 
 
 
269 aa  135  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  36.06 
 
 
267 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  32.83 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  32.05 
 
 
277 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  34.34 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  33.71 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  33.6 
 
 
260 aa  119  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  36.19 
 
 
271 aa  118  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  36.92 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  34.86 
 
 
257 aa  113  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10452  transmembrane protein  41.76 
 
 
178 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  33.99 
 
 
271 aa  108  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  30.71 
 
 
275 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  33.89 
 
 
277 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  32.7 
 
 
289 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  35.38 
 
 
261 aa  99.4  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  31.01 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  31.4 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  26.05 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  30.96 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  30.96 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  30.96 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47763  predicted protein  26.59 
 
 
311 aa  68.9  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  29.49 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02404  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05810)  28.44 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  32.73 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01900  hypothetical protein  23.39 
 
 
432 aa  55.5  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525027  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  34.86 
 
 
208 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  30 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  34.69 
 
 
304 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48600  predicted protein  26.13 
 
 
451 aa  52.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0049  hypothetical protein  23.94 
 
 
230 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.976461  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  27.87 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10451  transmembrane protein  48.08 
 
 
62 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1321  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.78 
 
 
239 aa  46.2  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  28.57 
 
 
488 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12101  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  24.1 
 
 
157 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35816  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15223  predicted protein  23.62 
 
 
313 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12111  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  24.39 
 
 
157 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.376517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2218  protein of unknown function DUF1295  24.19 
 
 
219 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  0.0389914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>