32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47763 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47763  predicted protein  100 
 
 
311 aa  642    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  40.74 
 
 
264 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04556  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02670)  36.62 
 
 
359 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.114313  normal  0.885943 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15223  predicted protein  38.18 
 
 
313 aa  138  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01900  hypothetical protein  25.87 
 
 
432 aa  76.3  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525027  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  24.73 
 
 
293 aa  63.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  24.54 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  27.72 
 
 
258 aa  55.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  26.22 
 
 
263 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  27.84 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  23.63 
 
 
269 aa  52.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  25.1 
 
 
267 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  24.04 
 
 
275 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  28.81 
 
 
273 aa  49.3  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  25.93 
 
 
262 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  28.47 
 
 
257 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  25 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  25.94 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  24.14 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  25.68 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  24.43 
 
 
273 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  23.45 
 
 
267 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  24.43 
 
 
273 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  24.4 
 
 
274 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  25.91 
 
 
253 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  24.64 
 
 
265 aa  46.6  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  24.56 
 
 
261 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  24.43 
 
 
296 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  23.9 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  24.4 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1234  hypothetical protein  28.05 
 
 
167 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0259963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  27.61 
 
 
269 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.672197 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>