62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1254 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  100 
 
 
267 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  57.56 
 
 
264 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  52.42 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  49.63 
 
 
270 aa  232  6e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  48.82 
 
 
264 aa  223  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  51.11 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  50.81 
 
 
275 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  47.52 
 
 
293 aa  202  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  44.23 
 
 
258 aa  199  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  50.2 
 
 
265 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  44.57 
 
 
256 aa  186  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  44.49 
 
 
264 aa  185  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  44.09 
 
 
256 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  42.58 
 
 
271 aa  179  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  41.76 
 
 
269 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  35.56 
 
 
261 aa  171  9e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  42.35 
 
 
297 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  44.88 
 
 
253 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  45.08 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  39.17 
 
 
258 aa  165  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  42.19 
 
 
263 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  43.75 
 
 
273 aa  155  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  43.7 
 
 
265 aa  149  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  35.34 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10452  transmembrane protein  48.02 
 
 
178 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  35.74 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  34.13 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  34.39 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  36.74 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  33.19 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  33.96 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  35.43 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  36.92 
 
 
269 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  33.21 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  34.65 
 
 
277 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  39.24 
 
 
271 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  35.98 
 
 
260 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  32.46 
 
 
275 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  31.56 
 
 
288 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  36.84 
 
 
261 aa  92.4  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  33.65 
 
 
293 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  32.64 
 
 
277 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  30.95 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  30.95 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  30.95 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  27.1 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  27.27 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  27.67 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02404  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05810)  28.17 
 
 
397 aa  65.9  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10451  transmembrane protein  52.83 
 
 
62 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  33.33 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  26.63 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  32.5 
 
 
304 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47763  predicted protein  25.1 
 
 
311 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  24.27 
 
 
208 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  42.11 
 
 
488 aa  49.3  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  24.42 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.86 
 
 
214 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48600  predicted protein  26.29 
 
 
451 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2029  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.83 
 
 
161 aa  42.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000425437  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  34.88 
 
 
253 aa  42  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  34.88 
 
 
253 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>