61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0246 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  503  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  52.96 
 
 
297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  54 
 
 
253 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  41.63 
 
 
256 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  45.67 
 
 
264 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  43.73 
 
 
273 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  43.7 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  39.33 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  42.15 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  41.43 
 
 
258 aa  162  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  44.62 
 
 
263 aa  156  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  40.23 
 
 
261 aa  152  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  41.88 
 
 
275 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  42.86 
 
 
264 aa  148  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  37.1 
 
 
258 aa  142  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  41.37 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  38.87 
 
 
260 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  35.38 
 
 
263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  37.97 
 
 
269 aa  135  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  40.46 
 
 
258 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  38.28 
 
 
267 aa  135  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  37.1 
 
 
293 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  37.64 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  41.39 
 
 
265 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  38 
 
 
264 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  33.73 
 
 
270 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  36.92 
 
 
277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  37.35 
 
 
267 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  36.9 
 
 
271 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  33.98 
 
 
293 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  36.25 
 
 
260 aa  99.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  34.32 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  35.58 
 
 
277 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  33.47 
 
 
269 aa  96.3  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  31.9 
 
 
279 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  33.33 
 
 
289 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  32.62 
 
 
275 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  31.73 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  31.42 
 
 
274 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  31 
 
 
261 aa  86.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  31 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  37.63 
 
 
261 aa  85.5  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  32.08 
 
 
296 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10452  transmembrane protein  35.2 
 
 
178 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  32.08 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  32.08 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  29.25 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  30.43 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02404  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05810)  32.92 
 
 
397 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.809933 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  31.88 
 
 
208 aa  60.1  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  32.89 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47763  predicted protein  26.97 
 
 
311 aa  52.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  33.03 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  29.61 
 
 
488 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0049  hypothetical protein  24.31 
 
 
230 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.976461  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  46.15 
 
 
269 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  33.9 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1321  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.64 
 
 
239 aa  45.8  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45361  predicted protein  22.93 
 
 
331 aa  45.4  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.79 
 
 
188 aa  42  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10451  transmembrane protein  52.08 
 
 
62 aa  42  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>