28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3401 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3401  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  545  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0910  hypothetical protein  61 
 
 		 271 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0005  putative integral membrane protein  26.32 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0003  hypothetical protein  26.32 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  29.37 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  30.26 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2587  putative integral membrane protein  27.82 
 
 		 252 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6423  hypothetical protein  28.81 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  27.64 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7385  hypothetical protein  26.78 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0660  hypothetical protein  30.16 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3486  putative integral membrane protein  32.52 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3549  putative integral membrane protein  32.52 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.393882  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3499  putative integral membrane protein  32.52 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.23601  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  36.36 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2947  putative integral membrane protein  29.22 
 
 		 262 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704391  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4814  putative integral membrane protein  22.83 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3040  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.25 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  32.56 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3239  hypothetical protein  28.64 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303297  normal  0.187673 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1324  hypothetical protein  27.36 
 
 		 196 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13267  integral membrane protein  34.78 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.849706  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  26.67 
 
 		 193 aa  46.2  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3140  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.06 
 
 		 152 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0549373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2487  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.06 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  29.89 
 
 		 197 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.36 
 
 		 198 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.4 
 
 		 206 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>