50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5116 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5116  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 
185 aa  358  3e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5950  hypothetical protein  67.86 
 
 
186 aa  207  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0274787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5141  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  63.69 
 
 
170 aa  201  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11162  hypothetical protein  60.24 
 
 
166 aa  200  9e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.247941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1087  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  64.67 
 
 
169 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113561  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2103  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  64.63 
 
 
169 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1195  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  62.13 
 
 
168 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1159  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  66.07 
 
 
172 aa  194  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.772846  hitchhiker  0.00322732 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1950  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  64.38 
 
 
189 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1060  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  64.07 
 
 
169 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1076  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  64.07 
 
 
169 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2368  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  53.14 
 
 
184 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57395  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2329  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  53.14 
 
 
184 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2376  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  53.14 
 
 
184 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00510  hypothetical protein  51.81 
 
 
175 aa  149  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.798456 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1085  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  52.07 
 
 
172 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1904  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  46.15 
 
 
184 aa  139  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.654377  hitchhiker  0.000324365 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2391  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  44.17 
 
 
207 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0429  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  44.17 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5653  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.79 
 
 
167 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1887  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  46.04 
 
 
201 aa  125  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0866287  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0397  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.56 
 
 
167 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.16097 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1612  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.26 
 
 
225 aa  120  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0227  hypothetical protein  42.51 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0203  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase domain-containing protein  41.67 
 
 
156 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1869  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  42.59 
 
 
167 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4104  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.88 
 
 
169 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346459  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2732  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.73 
 
 
202 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1797  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.11 
 
 
203 aa  61.6  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0211  hypothetical protein  26.62 
 
 
164 aa  57.8  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0205  hypothetical protein  26.62 
 
 
164 aa  57.8  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2408  hypothetical protein  25.97 
 
 
164 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.53 
 
 
209 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1868  hypothetical protein  26.44 
 
 
173 aa  52.4  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30 
 
 
219 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2611  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.72 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.25 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.37 
 
 
219 aa  47.8  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 
214 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  29.07 
 
 
189 aa  44.7  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.07 
 
 
189 aa  44.7  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2780  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.29 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0802217  hitchhiker  0.0000249152 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03462  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (icmt) family  39.71 
 
 
90 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.07 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.3 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.07 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.07 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.9 
 
 
189 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.3 
 
 
189 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9832  predicted protein  29.75 
 
 
187 aa  40.8  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>