27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0028 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0028  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
356 aa  736    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0016  NADPH-dependent FMN reductase  83.43 
 
 
356 aa  630  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0016  NADPH-dependent FMN reductase  75.14 
 
 
363 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0120399  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5240  NADPH-dependent FMN reductase  66.29 
 
 
368 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.88233  normal  0.0581864 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0075  hypothetical protein  65.63 
 
 
367 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652884  hitchhiker  0.00157318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4380  hypothetical protein  65.92 
 
 
373 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.186709  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5588  hypothetical protein  54.55 
 
 
366 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  hitchhiker  0.00697782 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4195  hypothetical protein  55.89 
 
 
327 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5263  hypothetical protein  35.56 
 
 
306 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3301  hypothetical protein  36.16 
 
 
263 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  26.74 
 
 
204 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  27.01 
 
 
210 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2017  hypothetical protein  21.61 
 
 
236 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  0.173884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  28.8 
 
 
193 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  24.64 
 
 
206 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 
208 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2184  iron-sulfur flavoprotein, putative  28.88 
 
 
201 aa  46.6  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0986799  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.19 
 
 
540 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  24.43 
 
 
192 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2659  NADPH-dependent FMN reductase  25.52 
 
 
205 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.385785 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  29.27 
 
 
186 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  26.02 
 
 
195 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  28 
 
 
179 aa  43.9  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1285  NADPH-dependent FMN reductase  23.44 
 
 
197 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.497649  normal  0.389555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  31.43 
 
 
178 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.43 
 
 
321 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  25.17 
 
 
177 aa  43.5  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>