37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0081 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0081  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 
408 aa  751    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6319  Tetratricopeptide TPR_4  84.94 
 
 
406 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5692  hypothetical protein  59.9 
 
 
406 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4115  hypothetical protein  61.73 
 
 
406 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6083  helix-turn-helix, type 11  62.38 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1994  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  62.38 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739767  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2014  hypothetical protein  62.13 
 
 
406 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1896  hypothetical protein  61.88 
 
 
406 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1331  putative transcriptional regulator, CadC  58.84 
 
 
406 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.900244  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2553  hypothetical protein  63.37 
 
 
406 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0543  hypothetical protein  59.75 
 
 
406 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.939754  normal  0.330299 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6465  hypothetical protein  59.26 
 
 
406 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.645 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2341  hypothetical protein  60.15 
 
 
406 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2027  hypothetical protein  61.14 
 
 
406 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0354  hypothetical protein  57.18 
 
 
413 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.856052  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0992  tetratricopeptide TPR_4  59.7 
 
 
406 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2054  hypothetical protein  62.13 
 
 
406 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594988  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5304  hypothetical protein  62.38 
 
 
406 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.967801  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3202  hypothetical protein  60.49 
 
 
407 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.480784  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2671  hypothetical protein  58.42 
 
 
406 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0727774  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4057  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  56.11 
 
 
406 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1282  hypothetical protein  63.25 
 
 
406 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0406727  normal  0.439874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1312  hypothetical protein  59.9 
 
 
406 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0250798  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6460  hypothetical protein  57.61 
 
 
406 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.678731  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3607  hypothetical protein  74.62 
 
 
421 aa  355  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0024  hypothetical protein  60.55 
 
 
406 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1376  hypothetical protein  60.49 
 
 
406 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379564  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3285  hypothetical protein  59.73 
 
 
367 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0105724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2027  peptidase cysteine peptidase active site  59.73 
 
 
367 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.986285  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4849  tetratricopeptide TPR_4  60.78 
 
 
407 aa  332  5e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3151  tetratricopeptide TPR_4  58.51 
 
 
419 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3200  TPR repeat-containing protein  58.87 
 
 
406 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2358  hypothetical protein  57.66 
 
 
414 aa  316  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634476  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0345  hypothetical protein  57.18 
 
 
416 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0361  hypothetical protein  55.92 
 
 
415 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0254485  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0374  hypothetical protein  55.42 
 
 
414 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103729  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.33 
 
 
316 aa  47.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>