22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0084 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0084  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  368  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6316  hypothetical protein  75.65 
 
 
198 aa  257  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5040  hypothetical protein  42.77 
 
 
221 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7221  hypothetical protein  40.83 
 
 
199 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4188  hypothetical protein  46.3 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2983  hypothetical protein  42.59 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000560028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2174  transmembrane protein  39.89 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0337  hypothetical protein  42.94 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2094  conserved transmembrane protein  37.64 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0089  hypothetical protein  41.1 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.081156  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0756  hypothetical protein  38.33 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144399  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1020  hypothetical protein  35.56 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113619  normal  0.37406 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5905  hypothetical protein  38.76 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1963  hypothetical protein  41.18 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2574  hypothetical protein  41.18 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2598  hypothetical protein  40.44 
 
 
221 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0723  hypothetical protein  40.6 
 
 
225 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.174182 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2870  hypothetical protein  40.74 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.922239  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2493  hypothetical protein  41.91 
 
 
221 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.998378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2622  hypothetical protein  42.34 
 
 
221 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1418  Gram-positive anchor  46.03 
 
 
262 aa  54.7  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1370  hypothetical protein  41.94 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.73391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>