More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2874 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2874  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  562  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  31.72 
 
 		 500 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  33.03 
 
 		 498 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.59 
 
 		 492 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.69 
 
 		 490 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.69 
 
 		 502 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  29.03 
 
 		 512 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  30.95 
 
 		 513 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.57 
 
 		 499 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  34.09 
 
 		 488 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  35.58 
 
 		 493 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  32.42 
 
 		 500 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  33.65 
 
 		 513 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  29.58 
 
 		 502 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  31.12 
 
 		 502 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  33.82 
 
 		 493 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  31.3 
 
 		 496 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  34.88 
 
 		 486 aa  109  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  29.82 
 
 		 499 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0491  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.43 
 
 		 504 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0936655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  31.14 
 
 		 496 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  30.28 
 
 		 515 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  30.28 
 
 		 510 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.28 
 
 		 515 aa  105  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.84 
 
 		 528 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  30.28 
 
 		 510 aa  105  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  30.28 
 
 		 515 aa  105  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1272  hypothetical protein  32.47 
 
 		 496 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  30.32 
 
 		 510 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  29.82 
 
 		 515 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  29.82 
 
 		 515 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  29.82 
 
 		 515 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  31.77 
 
 		 514 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.05 
 
 		 504 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  34.01 
 
 		 495 aa  99.8  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.08 
 
 		 513 aa  99.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.38 
 
 		 520 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  29.33 
 
 		 494 aa  99  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  25.66 
 
 		 514 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  30.43 
 
 		 490 aa  99  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  25.66 
 
 		 514 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  25.66 
 
 		 514 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  25.66 
 
 		 514 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.41 
 
 		 490 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  34.52 
 
 		 436 aa  96.7  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  29.9 
 
 		 510 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  25.66 
 
 		 514 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.92 
 
 		 496 aa  95.9  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  29.82 
 
 		 508 aa  95.9  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.31 
 
 		 531 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.44 
 
 		 490 aa  93.2  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.42 
 
 		 510 aa  92.4  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.56 
 
 		 490 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  28.7 
 
 		 524 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  29.21 
 
 		 501 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  29.21 
 
 		 501 aa  90.9  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2019  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.06 
 
 		 520 aa  90.9  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000259128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2596  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.02 
 
 		 486 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2570  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.9 
 
 		 513 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0989158  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28 
 
 		 514 aa  90.5  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  28.96 
 
 		 499 aa  89.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  26.07 
 
 		 493 aa  89.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.88 
 
 		 500 aa  89  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.66 
 
 		 532 aa  89  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  34.13 
 
 		 496 aa  89  8e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1546  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.53 
 
 		 496 aa  88.6  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157969  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.11 
 
 		 521 aa  88.6  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.24 
 
 		 500 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  30.53 
 
 		 503 aa  87.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  26.03 
 
 		 504 aa  87.8  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1846  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.32 
 
 		 212 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  27.4 
 
 		 519 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  26.03 
 
 		 504 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.17 
 
 		 499 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.94 
 
 		 519 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  26.03 
 
 		 504 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.01 
 
 		 525 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  27.27 
 
 		 530 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  30.66 
 
 		 535 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.12 
 
 		 514 aa  87  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.68 
 
 		 504 aa  86.7  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.44 
 
 		 542 aa  86.3  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.65 
 
 		 496 aa  85.9  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  25.22 
 
 		 519 aa  85.5  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.82 
 
 		 515 aa  85.5  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.24 
 
 		 517 aa  85.5  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.6 
 
 		 494 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.95 
 
 		 501 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.53 
 
 		 507 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.59 
 
 		 507 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  26.17 
 
 		 524 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  28.38 
 
 		 507 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1942  hypothetical protein  30.73 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.111661  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.93 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.74 
 
 		 531 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3313  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.25 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1517  YjeF-related protein-like  29.95 
 
 		 581 aa  83.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126424 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.57 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.67 
 
 		 530 aa  83.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1332  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.53 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.977936  normal  0.520853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>