More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1472 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  100 
 
 
520 aa  986    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  57.5 
 
 
535 aa  488  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  57.39 
 
 
530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  53.71 
 
 
536 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  49.9 
 
 
531 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  50.94 
 
 
554 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  51.46 
 
 
516 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  47.15 
 
 
558 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  44.44 
 
 
541 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  48.46 
 
 
549 aa  388  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  46.17 
 
 
535 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  47.37 
 
 
553 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  45.14 
 
 
541 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 
544 aa  363  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  46.98 
 
 
555 aa  359  8e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  45.25 
 
 
537 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  45.25 
 
 
537 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  45.25 
 
 
537 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  42.29 
 
 
548 aa  340  5e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  45.15 
 
 
565 aa  332  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  44.66 
 
 
511 aa  326  6e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  32.18 
 
 
534 aa  283  5.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  38.17 
 
 
539 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  38.71 
 
 
557 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.65 
 
 
536 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.2 
 
 
538 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  37.38 
 
 
531 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  36.74 
 
 
533 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  36.97 
 
 
530 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  30.94 
 
 
528 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  36.35 
 
 
531 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  29.89 
 
 
529 aa  254  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  31.43 
 
 
530 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  37.38 
 
 
545 aa  250  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  30.38 
 
 
529 aa  250  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  36.05 
 
 
526 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 
548 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  35.22 
 
 
524 aa  243  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  35.99 
 
 
527 aa  242  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  36.47 
 
 
535 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  37.22 
 
 
534 aa  240  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  32.2 
 
 
529 aa  240  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  35.74 
 
 
553 aa  236  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  29.98 
 
 
529 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  34.42 
 
 
541 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  33.53 
 
 
530 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  35.56 
 
 
548 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.81 
 
 
548 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  36.81 
 
 
548 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.81 
 
 
548 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.81 
 
 
548 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.81 
 
 
548 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  36.81 
 
 
548 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  36.81 
 
 
548 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  34.67 
 
 
525 aa  230  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  35.54 
 
 
535 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  34.87 
 
 
551 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  34.87 
 
 
551 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  37.07 
 
 
546 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  37.07 
 
 
546 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  37.34 
 
 
527 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  35.22 
 
 
550 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  34.48 
 
 
525 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  34.99 
 
 
532 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  37.58 
 
 
532 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  34.39 
 
 
525 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  34.67 
 
 
620 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  30.51 
 
 
643 aa  203  8e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  31.18 
 
 
645 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  30.22 
 
 
638 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  37.24 
 
 
632 aa  200  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 
524 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  36.98 
 
 
534 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  32.48 
 
 
664 aa  198  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 
545 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  31.65 
 
 
552 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  32.87 
 
 
540 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  28.43 
 
 
639 aa  193  8e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
545 aa  192  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  29.83 
 
 
634 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  31.84 
 
 
543 aa  192  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  29.68 
 
 
531 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  29.62 
 
 
523 aa  191  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  30.92 
 
 
644 aa  190  5e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  33.07 
 
 
540 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  36.82 
 
 
555 aa  189  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  33.01 
 
 
540 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  29.69 
 
 
879 aa  188  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  31.89 
 
 
540 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  32.44 
 
 
767 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  30.8 
 
 
581 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  33.14 
 
 
540 aa  188  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  33.14 
 
 
540 aa  187  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  30.28 
 
 
630 aa  187  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  34.67 
 
 
545 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.88 
 
 
641 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  33.07 
 
 
540 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  33.2 
 
 
540 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  31.47 
 
 
649 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  33.46 
 
 
545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>