97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1273 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
432 aa  825    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  41.25 
 
 
422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  36.13 
 
 
393 aa  96.3  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  28.82 
 
 
463 aa  89.7  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  29.97 
 
 
423 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  30.69 
 
 
422 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  32.62 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  35.33 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  33.08 
 
 
497 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  38.82 
 
 
439 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  30.94 
 
 
463 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  30.15 
 
 
564 aa  80.1  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  36.11 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  32.08 
 
 
431 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  31.54 
 
 
432 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  34.34 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  31.07 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  30.68 
 
 
415 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  26.75 
 
 
491 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  41.94 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  30.58 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  43.16 
 
 
407 aa  69.7  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  33.14 
 
 
442 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  42.59 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  35.22 
 
 
452 aa  67.4  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  30.94 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  35.93 
 
 
392 aa  67  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  41.12 
 
 
421 aa  66.2  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  31.28 
 
 
418 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  28.57 
 
 
479 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  43.52 
 
 
431 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  37.4 
 
 
442 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  38.53 
 
 
395 aa  63.5  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  29.44 
 
 
413 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  39.06 
 
 
375 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  39.76 
 
 
374 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  41.67 
 
 
410 aa  61.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  20 
 
 
401 aa  60.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  26.2 
 
 
426 aa  60.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  26.19 
 
 
419 aa  60.1  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  33.62 
 
 
428 aa  60.1  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  37.07 
 
 
412 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  37.07 
 
 
443 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  26.46 
 
 
436 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  43.88 
 
 
453 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  27.05 
 
 
384 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  32.12 
 
 
426 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  24.49 
 
 
443 aa  57.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  32.61 
 
 
334 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  30.42 
 
 
429 aa  57.4  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  37.96 
 
 
382 aa  56.6  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  28.57 
 
 
451 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  30.51 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  37.5 
 
 
453 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  33 
 
 
411 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  29.27 
 
 
440 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  34.02 
 
 
333 aa  53.1  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  31.41 
 
 
412 aa  53.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  26.49 
 
 
552 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  34.78 
 
 
561 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  28.91 
 
 
444 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  30.05 
 
 
399 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  30.68 
 
 
391 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  32.12 
 
 
440 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  37.37 
 
 
402 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  23.65 
 
 
402 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  24.04 
 
 
446 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  30.47 
 
 
448 aa  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  25.86 
 
 
398 aa  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  34.19 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  24.62 
 
 
450 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  32.11 
 
 
430 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  20.33 
 
 
380 aa  47.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2239  protein of unknown function DUF58  27.54 
 
 
451 aa  47.4  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  41.41 
 
 
370 aa  47.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  25.45 
 
 
294 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
325 aa  47  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  25.26 
 
 
453 aa  47  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0388  protein of unknown function DUF58  28.12 
 
 
372 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  26.23 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  28.33 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  20.97 
 
 
405 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  20.41 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  24.37 
 
 
425 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  20.57 
 
 
404 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1182  hypothetical protein  30.23 
 
 
422 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  34 
 
 
430 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  33.01 
 
 
326 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0405  hypothetical protein  29.06 
 
 
434 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0482849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  20.9 
 
 
444 aa  44.3  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5140  protein of unknown function DUF58  31.63 
 
 
312 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  29.55 
 
 
436 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  35.34 
 
 
454 aa  43.9  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  27.59 
 
 
395 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  18.59 
 
 
405 aa  43.9  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0407  hypothetical protein  22.66 
 
 
415 aa  43.9  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0240441  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  29.29 
 
 
450 aa  43.1  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>