161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4790 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  100 
 
 		 335 aa  674    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  50.73 
 
 		 349 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  51.52 
 
 		 351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  45.24 
 
 		 347 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  44.12 
 
 		 333 aa  239  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  40.54 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  39.88 
 
 		 336 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  43.05 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  40.84 
 
 		 329 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  40.3 
 
 		 336 aa  222  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  44.29 
 
 		 358 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  37.69 
 
 		 331 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  36.78 
 
 		 347 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  36.78 
 
 		 331 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  40 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  40.74 
 
 		 360 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  38.07 
 
 		 335 aa  209  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  38.08 
 
 		 315 aa  209  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  41.58 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  37.88 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  39.32 
 
 		 339 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  37.99 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  40.79 
 
 		 350 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  39.19 
 
 		 348 aa  202  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  37.46 
 
 		 334 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  36.71 
 
 		 347 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  44.4 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  35.76 
 
 		 337 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  36.27 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  42.98 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  38.75 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  41.63 
 
 		 342 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  34.78 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  35.78 
 
 		 328 aa  182  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  35.78 
 
 		 328 aa  182  8.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  43.62 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  37.42 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  37.46 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  35 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  37.9 
 
 		 343 aa  169  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  34.34 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  35.29 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  32.07 
 
 		 334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  35.98 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  32.79 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  32.94 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  28.91 
 
 		 335 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  33.21 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  32.97 
 
 		 328 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  38.12 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  38.22 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  37.29 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  35.21 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  30.41 
 
 		 360 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  30.41 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  34.31 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  34.31 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  29.3 
 
 		 293 aa  57  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  29.3 
 
 		 293 aa  57  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  31.72 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  31.45 
 
 		 605 aa  56.2  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  26.14 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 284 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  27.97 
 
 		 668 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2880  parB-like partition protein  33.08 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3503  parB-like partition protein  34.97 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.576785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  29.45 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  27.12 
 
 		 281 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  28.78 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3888  parB-like partition protein  31.21 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  31.37 
 
 		 274 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  35 
 
 		 297 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3173  parB-like partition protein  27.34 
 
 		 303 aa  53.1  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  31.25 
 
 		 324 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  28.06 
 
 		 334 aa  52.8  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  32.12 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  28.49 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  29.29 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  29.94 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1370  ParB family protein  31.01 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  30 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  34.65 
 
 		 280 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5196  ParB family protein  34.17 
 
 		 549 aa  50.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  28.99 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  27.59 
 
 		 335 aa  50.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  31.69 
 
 		 303 aa  50.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  29.89 
 
 		 359 aa  50.1  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  29.9 
 
 		 344 aa  49.7  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  32.52 
 
 		 392 aa  49.3  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  30.07 
 
 		 298 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  28 
 
 		 297 aa  49.3  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  23.38 
 
 		 337 aa  49.3  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  28.31 
 
 		 286 aa  49.3  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  32.2 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  30.07 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  35.53 
 
 		 607 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  28.68 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3744  RC101  28.19 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.803465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  26.62 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>