More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3880 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  100 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  73.02 
 
 		 252 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  74.21 
 
 		 252 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  72.22 
 
 		 252 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  71.31 
 
 		 252 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  72.22 
 
 		 252 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  71.54 
 
 		 253 aa  374  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  71.83 
 
 		 252 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  66.25 
 
 		 263 aa  329  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  65.83 
 
 		 263 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  61.45 
 
 		 260 aa  317  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  61.45 
 
 		 260 aa  317  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  64.17 
 
 		 271 aa  317  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  63.1 
 
 		 263 aa  315  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  61.6 
 
 		 260 aa  315  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  63.33 
 
 		 268 aa  315  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  62.92 
 
 		 268 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  61.94 
 
 		 259 aa  312  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  62.92 
 
 		 268 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  60.8 
 
 		 268 aa  308  8e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  62.04 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  56.79 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  57.92 
 
 		 260 aa  278  5e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  56.05 
 
 		 247 aa  274  8e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  55.2 
 
 		 247 aa  272  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  53.72 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  54.51 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  52.89 
 
 		 236 aa  254  9e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  51.61 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  50.74 
 
 		 279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  51.31 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  50.59 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  50.94 
 
 		 262 aa  238  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  50 
 
 		 259 aa  238  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  47.67 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  51.69 
 
 		 263 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  52.78 
 
 		 235 aa  223  3e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  47.96 
 
 		 261 aa  222  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  48.06 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  50.66 
 
 		 248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  45.8 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  45.57 
 
 		 287 aa  202  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  45.24 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  46.43 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  48.42 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  45.09 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  44.02 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  46.64 
 
 		 256 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  47.32 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  44.14 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  41.47 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  41.06 
 
 		 278 aa  169  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  42.29 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  44.5 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  43.58 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  41.33 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  40.89 
 
 		 297 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  40.89 
 
 		 297 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  40.89 
 
 		 297 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  40.89 
 
 		 297 aa  148  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  43.19 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  38.37 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  38.61 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  42.73 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  40.44 
 
 		 297 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  38.93 
 
 		 301 aa  145  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  40.44 
 
 		 297 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  39.38 
 
 		 298 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  43.14 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  43.14 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  41.23 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  36.65 
 
 		 322 aa  144  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  42.25 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  40.36 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  39.3 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  40 
 
 		 270 aa  142  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  38.14 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  38.14 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  38.58 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  38.58 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  38.58 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  37.84 
 
 		 305 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  37.84 
 
 		 305 aa  141  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  37.45 
 
 		 305 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  37.45 
 
 		 305 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  37.45 
 
 		 305 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  37.45 
 
 		 305 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  36.84 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  36.84 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  36.84 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  36.84 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  41.89 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  36.84 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  36.2 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  41.71 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  35.94 
 
 		 325 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  40.18 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  37.69 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  40 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  35.79 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>