More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2569 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2569  response regulator receiver protein  100 
 
 		 132 aa  257  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.929319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  43.93 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  44.04 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.43 
 
 		 966 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.37 
 
 		 927 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  40.91 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 943 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  37.61 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  36.89 
 
 		 949 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  38.52 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  38.53 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 949 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1036 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 951 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5650  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.64647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  37.1 
 
 		 1036 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  33.64 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 905 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  39.55 
 
 		 701 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2449  response regulator receiver  36.36 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000856797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5929  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 1631 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  38.53 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 		 926 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  38 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4683  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  36.94 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 810 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.57 
 
 		 1067 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  40.23 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 618 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1228  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 769 aa  68.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  40.23 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 705 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 1651 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  40.2 
 
 		 812 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 789 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 127 aa  67  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 1164 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  40.4 
 
 		 1164 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 807 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0119  sensor histidine kinase with PAS/PAC  40 
 
 		 909 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 699 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2991  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 		 766 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 711 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 		 727 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 688 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 		 727 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 707 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 1053 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 		 721 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115994  normal  0.0775846 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 793 aa  65.1  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4234  sensor histidine kinase  35.09 
 
 		 761 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 		 662 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2043  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 691 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 703 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 1105 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 1646 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  34.21 
 
 		 829 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 		 701 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 		 793 aa  63.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.43 
 
 		 651 aa  63.5  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  35.09 
 
 		 490 aa  63.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  34.55 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0225  PAS  38.94 
 
 		 673 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2650  response regulator receiver domain-containing protein  30.65 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 853 aa  62.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  34.58 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2146  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41399  hitchhiker  0.000968824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2110  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  37.39 
 
 		 754 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 752 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 743 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 859 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2217  histidine kinase  38.32 
 
 		 396 aa  62  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  41.58 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 		 766 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 770 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>