More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1589 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  68.4 
 
 
545 aa  694    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.528462  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  67.97 
 
 
545 aa  687    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.86 
 
 
583 aa  653    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.66 
 
 
568 aa  646    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.181916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.67 
 
 
567 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.323707  normal  0.0708927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1589  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
609 aa  1211    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4525  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.09 
 
 
691 aa  676    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0260  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.58 
 
 
577 aa  652    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4919  putative DEAD-box cold-shock protein, ATP-independent RNA helicase  59.42 
 
 
656 aa  673    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.730754  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1386  DEAD/DEAH box helicase  61.17 
 
 
677 aa  646    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0179  DEAD/DEAH box helicase  64.4 
 
 
679 aa  676    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.970165  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0876  DEAD/DEAH box helicase-like  60.68 
 
 
659 aa  709    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3218  DEAD/DEAH box helicase-like  59.43 
 
 
691 aa  679    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4914  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.48 
 
 
568 aa  644    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2184  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.77 
 
 
776 aa  633  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.61 
 
 
593 aa  615  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.172046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2584  DEAD/DEAH box helicase-like  61.77 
 
 
590 aa  607  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.780763  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1844  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.69 
 
 
574 aa  605  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360564  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1119  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.59 
 
 
596 aa  605  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.538016 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  72.58 
 
 
505 aa  599  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.295607 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1832  DEAD/DEAH box helicase-like protein  57.8 
 
 
610 aa  595  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00214348  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2023  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.31 
 
 
651 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.995582  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1826  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.82 
 
 
659 aa  595  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2871  cold-shock dead-box protein A  55.76 
 
 
673 aa  589  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.975529  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0067  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.69 
 
 
626 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237297  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0900  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.14 
 
 
787 aa  565  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00172468  normal  0.0499652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.81 
 
 
644 aa  557  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0120  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  54.58 
 
 
626 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  54.39 
 
 
626 aa  549  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.232236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2913  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.7 
 
 
585 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898805  normal  0.138469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2893  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.93 
 
 
764 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0135  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.94 
 
 
793 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776582  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1574  DEAD/DEAH box helicase-like  54.22 
 
 
706 aa  531  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226882  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4366  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.82 
 
 
687 aa  531  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0590  DEAD/DEAH box helicase-like  47.98 
 
 
710 aa  526  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0850  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.05 
 
 
730 aa  521  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00336665  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1485  ATP-dependent RNA helicase  57.36 
 
 
602 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.59 
 
 
565 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.629149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3142  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.59 
 
 
565 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3044  DEAD/DEAH box helicase-like  55.95 
 
 
565 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4213  DEAD/DEAH box helicase-like  72.66 
 
 
340 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.985867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.65 
 
 
558 aa  289  1e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000225477  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.55 
 
 
597 aa  276  7e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  38.6 
 
 
570 aa  275  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.32 
 
 
527 aa  269  8.999999999999999e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.91 
 
 
533 aa  269  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2820  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.31 
 
 
556 aa  265  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00179058  normal  0.0521879 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.4 
 
 
541 aa  264  4e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  37.73 
 
 
561 aa  264  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.88 
 
 
565 aa  263  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.21 
 
 
640 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.43 
 
 
527 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.61 
 
 
643 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.39 
 
 
637 aa  261  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.3 
 
 
653 aa  260  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  34.71 
 
 
572 aa  260  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.05 
 
 
561 aa  259  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0522  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.5 
 
 
562 aa  259  8e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0704  ATP-dependent RNA helicase  32.95 
 
 
601 aa  259  8e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.9 
 
 
640 aa  259  9e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.9 
 
 
640 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.9 
 
 
640 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1648  DEAD/DEAH box helicase-like  35.96 
 
 
607 aa  259  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.57 
 
 
532 aa  259  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.9 
 
 
640 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.4 
 
 
532 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.48 
 
 
550 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.57 
 
 
678 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09651  putative ATP-dependent RNA helicase  35.44 
 
 
636 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.91 
 
 
546 aa  258  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.03 
 
 
623 aa  258  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  31.6 
 
 
656 aa  257  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.04 
 
 
527 aa  258  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.06 
 
 
747 aa  258  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.16 
 
 
529 aa  257  4e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.73 
 
 
546 aa  257  4e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2564  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.19 
 
 
634 aa  257  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347829  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.21 
 
 
625 aa  257  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.08 
 
 
530 aa  257  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.85 
 
 
584 aa  257  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2144  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.68 
 
 
560 aa  256  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101709  normal  0.616746 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.94 
 
 
634 aa  256  9e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3577  ATP-dependent RNA helicase DbpA  44.19 
 
 
473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.61 
 
 
532 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.33 
 
 
664 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3753  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.3 
 
 
908 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237591  normal  0.30492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.86 
 
 
694 aa  254  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0117058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.82 
 
 
622 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.82 
 
 
619 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.03 
 
 
624 aa  254  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.33 
 
 
664 aa  254  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3342  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.11 
 
 
607 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000502308  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.33 
 
 
664 aa  254  4.0000000000000004e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.82 
 
 
622 aa  253  6e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.2 
 
 
550 aa  253  6e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0919  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.12 
 
 
632 aa  253  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.59 
 
 
610 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2250  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.76 
 
 
574 aa  253  9.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460178  normal  0.714612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1477  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.79 
 
 
559 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682084  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3619  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.27 
 
 
557 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.219568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>