More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4624 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
301 aa  619  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  59.67 
 
 
304 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.67 
 
 
304 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.47 
 
 
334 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  57.91 
 
 
305 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56 
 
 
304 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.67 
 
 
304 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.13 
 
 
301 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  57.91 
 
 
305 aa  359  4e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.81 
 
 
306 aa  357  9e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.21 
 
 
301 aa  355  5.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.47 
 
 
305 aa  342  4e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.47 
 
 
305 aa  342  4e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6296  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.97 
 
 
305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953973  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.82 
 
 
303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.97 
 
 
301 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3902  putative short-chain dehydrogenase  56.47 
 
 
350 aa  329  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4414  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.48 
 
 
304 aa  322  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.27323  normal  0.448536 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.81 
 
 
304 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.33 
 
 
303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.16 
 
 
306 aa  308  8e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.99 
 
 
305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157995  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.5 
 
 
304 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.72 
 
 
287 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.72 
 
 
287 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0938298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.29 
 
 
288 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.88 
 
 
309 aa  222  6e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
299 aa  219  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 
317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.44 
 
 
287 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.44 
 
 
287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13581  short chain dehydrogenase  45.14 
 
 
304 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0990591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  46.12 
 
 
286 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.09 
 
 
304 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  44.09 
 
 
301 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  44.09 
 
 
301 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  44.09 
 
 
301 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  41.41 
 
 
306 aa  208  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  42.05 
 
 
301 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
298 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  44.88 
 
 
301 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19730  oxidoreductase  46.06 
 
 
303 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1699  short-chain dehydrogenase  46.06 
 
 
303 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.650982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.01 
 
 
303 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.12 
 
 
306 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.76 
 
 
310 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0181126  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1025  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.64 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 
302 aa  195  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928177  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
292 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.39 
 
 
913 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
303 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170855 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
303 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.935758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
305 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  41.87 
 
 
901 aa  190  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.14 
 
 
305 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.01 
 
 
300 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7556  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
310 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206699  normal  0.239691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.72 
 
 
305 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
301 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407831  normal  0.964751 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.46 
 
 
301 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2341  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 
291 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199722  decreased coverage  0.00200779 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
710 aa  186  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  48.26 
 
 
903 aa  185  7e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.72 
 
 
305 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
302 aa  185  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.91 
 
 
300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3584  putative 3-oxo-(acyl) acyl carrier protein reductase  40.86 
 
 
305 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.185975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5003  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  39.08 
 
 
292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.874894  normal  0.0924335 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 
300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.490724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
301 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
301 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
253 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
326 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130256  normal  0.744191 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  39.59 
 
 
893 aa  177  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 
307 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
301 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 
304 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.119324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
306 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.11 
 
 
247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.27 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.43 
 
 
247 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
351 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0948  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.32 
 
 
249 aa  172  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000118605  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 
313 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
315 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
310 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
307 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.857131  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.46 
 
 
250 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.46 
 
 
250 aa  168  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.37 
 
 
248 aa  168  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
332 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323003  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.87 
 
 
246 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.62 
 
 
246 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.89 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>