129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3759 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3759  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  100 
 
 		 500 aa  1033    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4241  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  49.15 
 
 		 555 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6048  UvrD Superfamily I DNA and RNA helicase  39.01 
 
 		 645 aa  273  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1452  hypothetical protein  35.56 
 
 		 487 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0879  hypothetical protein  35.15 
 
 		 485 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0186  hypothetical protein  35.19 
 
 		 503 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.589701  hitchhiker  0.00261133 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2787  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  35.87 
 
 		 519 aa  253  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.803649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3358  hypothetical protein  34.84 
 
 		 509 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0120  hypothetical protein  36.72 
 
 		 647 aa  249  9e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4050  hypothetical protein  34.62 
 
 		 481 aa  240  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0926  F-box only protein 18  30.48 
 
 		 498 aa  229  6e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0098755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4503  DNA helicase  33.54 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59830  putative helicase  33.33 
 
 		 493 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000685074  hitchhiker  7.95621e-18 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3510  superfamily I DNA/RNA helicase  28.37 
 
 		 600 aa  193  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.418094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0575  UvrD/REP helicase  31.76 
 
 		 536 aa  186  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000167989  unclonable  0.00000359794 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6248  putative DNA helicase  29.25 
 
 		 486 aa  183  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2163  putative DNA helicase  27.97 
 
 		 518 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1569  putative DNA helicase  29.96 
 
 		 486 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5233  putative helicase superfamily I  29.96 
 
 		 486 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161896  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14422  predicted protein  26.67 
 
 		 1658 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.799653  normal  0.0906106 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2003  DNA helicase  29.54 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2306  putative DNA helicase  29.1 
 
 		 499 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2323  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.9 
 
 		 505 aa  152  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488765 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3757  putative DNA helicase  27.11 
 
 		 501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4323  hypothetical protein  30.11 
 
 		 511 aa  146  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4987  putative helicase superfamily I  27.84 
 
 		 500 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3627  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.92 
 
 		 513 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.180644  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1611  UvrD/REP helicase  27.55 
 
 		 729 aa  57.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780541  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  28.29 
 
 		 789 aa  55.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1050  UvrD/REP helicase  25.18 
 
 		 597 aa  55.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.24 
 
 		 742 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 783 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1264  UvrD/REP helicase  23.53 
 
 		 678 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3655  UvrD/REP helicase  38.1 
 
 		 774 aa  51.6  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47860  ATP-dependent DNA helicase Rep protein  26.05 
 
 		 669 aa  52  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  33.33 
 
 		 724 aa  51.2  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1715  UvrD/REP helicase  33.67 
 
 		 462 aa  50.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000356586  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  31.4 
 
 		 759 aa  50.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  23.93 
 
 		 769 aa  50.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  24.21 
 
 		 666 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  24.77 
 
 		 739 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  25.44 
 
 		 1059 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  25.08 
 
 		 666 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.55 
 
 		 732 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5440  UvrD/REP helicase  38.96 
 
 		 1051 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202358 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  53.33 
 
 		 946 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  53.33 
 
 		 946 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  25.34 
 
 		 757 aa  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  31.82 
 
 		 736 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  23.26 
 
 		 724 aa  48.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0661  UvrD/REP helicase  24.81 
 
 		 708 aa  48.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612479  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  29.91 
 
 		 700 aa  47.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.37 
 
 		 658 aa  47.4  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  25.5 
 
 		 726 aa  47  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1057 aa  47  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2233  ATP-dependent DNA helicase  35.37 
 
 		 658 aa  47  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  33.73 
 
 		 735 aa  47  0.0009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1534  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.53 
 
 		 1204 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  25.61 
 
 		 773 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1209  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.88 
 
 		 1097 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686656 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  33.6 
 
 		 845 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  32.38 
 
 		 724 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  35.94 
 
 		 659 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  24.81 
 
 		 735 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  26.55 
 
 		 724 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  32.38 
 
 		 724 aa  46.2  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.82 
 
 		 830 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  39.13 
 
 		 620 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1708  UvrD/REP helicase  32.47 
 
 		 695 aa  45.8  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  32.71 
 
 		 723 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0209  DNA-dependent helicase II  33.02 
 
 		 720 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  31.46 
 
 		 807 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0545  DNA-dependent helicase II  33.02 
 
 		 720 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4007  DNA-dependent helicase II  33.02 
 
 		 720 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  34.91 
 
 		 720 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  34.91 
 
 		 720 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  34.91 
 
 		 720 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  34.91 
 
 		 720 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  34.91 
 
 		 720 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.84 
 
 		 755 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  29.27 
 
 		 768 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  31.51 
 
 		 1207 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  28.33 
 
 		 1200 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  27.92 
 
 		 741 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  30.77 
 
 		 762 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4241  UvrD/REP helicase  46.81 
 
 		 907 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000158675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  33.98 
 
 		 723 aa  45.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  29.32 
 
 		 732 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.82 
 
 		 837 aa  45.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  27.78 
 
 		 711 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2897  UvrD/REP helicase  24.77 
 
 		 684 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0777832  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  25.21 
 
 		 726 aa  44.3  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  31.48 
 
 		 722 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  31.48 
 
 		 722 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  31.48 
 
 		 722 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.75 
 
 		 685 aa  44.3  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2149  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  36.62 
 
 		 1203 aa  44.3  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277093  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  37.65 
 
 		 720 aa  44.3  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  29.32 
 
 		 731 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  39.44 
 
 		 1173 aa  44.3  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>