70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4443 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 165 aa  309  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  39.74 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  36.99 
 
 		 183 aa  85.1  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  36.99 
 
 		 183 aa  85.1  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  39.49 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  40.13 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  37.82 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  39.6 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  39.6 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  46.6 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  37.58 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  37.58 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  37.58 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  38.93 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  38.93 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  38.93 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  38.93 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  38.93 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2074  peptidase A24A prepilin type IV  41.67 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1400  peptidase A24A, prepilin type IV  35.19 
 
 		 166 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174968  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  41.35 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  38.67 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2801  putative prepilin peptidase transmembrane protein, CpaA like  40.76 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  46.53 
 
 		 192 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  45 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  36.21 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2318  peptidase A24A prepilin type IV  36.25 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20935 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  31.34 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  30.97 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3759  peptidase A24A, prepilin type IV  43.88 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal  0.405362 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1335  peptidase A24A, prepilin type IV  32.46 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.936907  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2561  peptidase A24A prepilin type IV  36.84 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  31.29 
 
 		 258 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0333  peptidase A24A, prepilin type IV  30.54 
 
 		 175 aa  47.4  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  34.21 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  36.92 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2354  hypothetical protein  39.77 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.306931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2350  peptidase A24A, prepilin type IV  45.88 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.747166  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  42 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2391  peptidase A24A, prepilin type IV  45.88 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.300874  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2397  peptidase A24A, prepilin type IV  45.88 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  28.14 
 
 		 250 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  32.35 
 
 		 287 aa  44.3  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  32.35 
 
 		 287 aa  44.3  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  38.46 
 
 		 204 aa  44.3  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  29.34 
 
 		 183 aa  44.3  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  38.46 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  38.46 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  38.67 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2321  peptidase A24A prepilin type IV  34.13 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  31.97 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1980  peptidase A24A prepilin type IV  38.18 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175431  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2165  peptidase A24A, prepilin type IV  34.55 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.065681 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  28.4 
 
 		 300 aa  42.4  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  39.13 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  36.04 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3711  peptidase A24A, prepilin type IV  34.82 
 
 		 174 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  29.05 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0841  peptidase A24A prepilin type IV  43.82 
 
 		 146 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  34.86 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0620  peptidase A24A prepilin type IV  35 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450509 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0614  peptidase A24A, prepilin type IV  35 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0179326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  40 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  28.85 
 
 		 254 aa  41.2  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0657  prepilin peptidase transmembrane protein  29.14 
 
 		 172 aa  41.2  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.6385  normal  0.502412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0575  hypothetical protein  35 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  34.31 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  35.24 
 
 		 159 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.77 
 
 		 247 aa  40.4  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  26.19 
 
 		 255 aa  40.4  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>