More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1799 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  100 
 
 		 298 aa  598  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  67.25 
 
 		 318 aa  339  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  63.92 
 
 		 299 aa  335  5e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  64.18 
 
 		 292 aa  328  8e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  60.74 
 
 		 303 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  60.2 
 
 		 303 aa  315  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  63.1 
 
 		 301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  55.37 
 
 		 317 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  56.77 
 
 		 292 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  52.06 
 
 		 295 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  53.36 
 
 		 315 aa  276  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  51.8 
 
 		 296 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  51.8 
 
 		 296 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  52.88 
 
 		 296 aa  254  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  48.54 
 
 		 315 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  48.41 
 
 		 311 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  51.54 
 
 		 295 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  50.49 
 
 		 312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  50.98 
 
 		 292 aa  241  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  51.02 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  50.17 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  55.9 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  43.65 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  47.83 
 
 		 298 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  47.83 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  47.83 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  47.83 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  47.83 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  47.83 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  47.83 
 
 		 292 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  49.31 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  56.33 
 
 		 230 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  48.8 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  52.4 
 
 		 268 aa  228  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  54.19 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  54.78 
 
 		 240 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  53.3 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  53.71 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  48.94 
 
 		 293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  52.4 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  49.78 
 
 		 236 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  51.53 
 
 		 236 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  50.66 
 
 		 233 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  50.66 
 
 		 233 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  50.66 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  50.66 
 
 		 233 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  50.66 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  50.66 
 
 		 233 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  49.78 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  47.33 
 
 		 274 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  47.41 
 
 		 284 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  53.28 
 
 		 239 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  41.69 
 
 		 270 aa  199  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  40.54 
 
 		 252 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  41.87 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  54.15 
 
 		 233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  53.71 
 
 		 233 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  53.71 
 
 		 233 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  52.84 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  41.18 
 
 		 288 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  46.84 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  37.16 
 
 		 333 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  42.05 
 
 		 288 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  46.19 
 
 		 262 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  42.37 
 
 		 290 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  42.08 
 
 		 374 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  43.48 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  40.4 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  39.13 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  43.29 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  36.47 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  45.65 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  41.44 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  37.63 
 
 		 285 aa  178  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  40.15 
 
 		 377 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  40.15 
 
 		 377 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  40.15 
 
 		 377 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  40.15 
 
 		 377 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  40.15 
 
 		 377 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  41.7 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  41.7 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  41.7 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  41.7 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  41.7 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  41.7 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  38.71 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  38.2 
 
 		 379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  38.2 
 
 		 363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  38.17 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  38.2 
 
 		 379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  39.93 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  35.8 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  37.85 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  46.15 
 
 		 261 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  45.99 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0837  peptidoglycan-binding protein LysM  42.01 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239144  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  37.54 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  35.15 
 
 		 272 aa  169  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  34.38 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  35.44 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>