More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1584 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1584  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  80.24 
 
 		 259 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4753  ABC transporter-related protein  80.88 
 
 		 257 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  78.66 
 
 		 259 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  75.59 
 
 		 255 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  75.59 
 
 		 255 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  75.59 
 
 		 255 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  73.62 
 
 		 255 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  73.23 
 
 		 255 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  73.2 
 
 		 256 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  73.2 
 
 		 256 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  71.26 
 
 		 255 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  59.13 
 
 		 255 aa  292  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  57.89 
 
 		 251 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  57.49 
 
 		 250 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.49 
 
 		 250 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  59.11 
 
 		 273 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  53.66 
 
 		 253 aa  265  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  44.8 
 
 		 256 aa  222  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  44.53 
 
 		 250 aa  218  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1801  ABC transporter related  48.78 
 
 		 253 aa  211  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.627304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  42.23 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  42.39 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  41.04 
 
 		 263 aa  208  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  47.74 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  40.78 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  43.82 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  41.77 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  41.2 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.92 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.84 
 
 		 263 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  43.72 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.52 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  40.73 
 
 		 250 aa  202  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  39.84 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  39.92 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  39.92 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  43.2 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  41.37 
 
 		 256 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0101  ABC transporter related  39.92 
 
 		 259 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2972  ABC transporter related  39.92 
 
 		 259 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0083  ABC transporter related  39.92 
 
 		 259 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4067  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 		 259 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2934  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 		 259 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0200  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 		 259 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.519343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1609  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 		 259 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3377  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 		 259 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3993  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 		 259 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 		 259 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  41.37 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  39.92 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  39.92 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  40.4 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  40.82 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  39.52 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  40.82 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0083  ABC transporter related  39.52 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  40.82 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0006  ABC transporter related  39.76 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.362312  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  40.82 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  42.58 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  39.52 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  41.37 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  39.52 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  42.11 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  39.52 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  44.86 
 
 		 233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  39.52 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  42.34 
 
 		 258 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  42.62 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  39.52 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 		 250 aa  194  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  43.15 
 
 		 251 aa  194  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  44.94 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.52 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  43.09 
 
 		 260 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  38.4 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  41.04 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  38.65 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  40.4 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  41.22 
 
 		 248 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  40.08 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 		 249 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  38.71 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  41.08 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  39.6 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 		 251 aa  191  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  41.43 
 
 		 250 aa  191  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  38.46 
 
 		 256 aa  191  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  41.39 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  38.58 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  40.8 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  38.31 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  38.31 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  38.55 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  42.34 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  38.55 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  42.06 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  40.89 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  42.68 
 
 		 249 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>