229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1530 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  100 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  48.33 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  53.05 
 
 		 318 aa  261  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  46.71 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  48.18 
 
 		 313 aa  252  7e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  50.94 
 
 		 296 aa  249  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  46.38 
 
 		 312 aa  248  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  51.53 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  51.53 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  51.15 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  51.91 
 
 		 324 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  51.91 
 
 		 324 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  51.91 
 
 		 324 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  51.15 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  44.74 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0543  type II secretion system protein  46.44 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0603407  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  47.45 
 
 		 315 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5326  type II secretion system protein  53.56 
 
 		 323 aa  221  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0355396 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  45.43 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  46.47 
 
 		 323 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  42.86 
 
 		 320 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  41.51 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  40.62 
 
 		 320 aa  192  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  40.98 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  37.82 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  38.13 
 
 		 316 aa  185  9e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  42.68 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  36.81 
 
 		 326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  41.27 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  38.33 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  41.7 
 
 		 326 aa  175  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  40.5 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1916  type II secretion system protein  34.98 
 
 		 312 aa  172  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141806  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  41.13 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  38.89 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  36.25 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  37.08 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  43.67 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  36.12 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  43.89 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  35.34 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  36.9 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  42.29 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  34.78 
 
 		 302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  37.55 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  38.94 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  32.86 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  34.69 
 
 		 326 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  34.69 
 
 		 326 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  33.78 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  34.44 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  38.25 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  36.05 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  34.36 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  34.98 
 
 		 324 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  35.22 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  41.46 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  40.55 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  39.23 
 
 		 328 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  35.09 
 
 		 331 aa  132  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  41.07 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  41.76 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  33.19 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  35.16 
 
 		 333 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  33.18 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  40.96 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2485  type II secretion system protein  33.92 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.28616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2708  type II secretion system protein  33.92 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2413  type II secretion system protein  34.51 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  38.92 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  34.08 
 
 		 325 aa  125  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  33.63 
 
 		 325 aa  125  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  33.18 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  38.32 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  34.68 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 347 aa  123  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  32.3 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2571  type II secretion system protein  37.14 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  38.32 
 
 		 324 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  33.04 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  34.85 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  34.96 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  31.47 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0311  type II secretion system protein  38.1 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  37.64 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  38.1 
 
 		 643 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  39.52 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  35.95 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  36.9 
 
 		 318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  33.8 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  36.31 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  40.62 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  36.31 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  34.68 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  32.97 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  35.8 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  37.22 
 
 		 294 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  33.82 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  33.64 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>