More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0294 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0294  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 249 aa  498  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  43.35 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  41.84 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  44 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  43.86 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  42.54 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  40.17 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  42.36 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  42.92 
 
 		 241 aa  158  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  40.57 
 
 		 248 aa  158  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  41.92 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  41.7 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  37.02 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  37.33 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  38.4 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  40.76 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  38.24 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  40.66 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  40.82 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  43.48 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  41.94 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  42.44 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  42.61 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  36.11 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  42.21 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  37.66 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  38.46 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  37.12 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  36.65 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  41.4 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  39.68 
 
 		 258 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  34.94 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  34.17 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  35.09 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  41.63 
 
 		 250 aa  142  7e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  38.62 
 
 		 252 aa  141  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  39.29 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  37.44 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  35.44 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  41.63 
 
 		 284 aa  138  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  40.5 
 
 		 250 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  39.06 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  38.3 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  35.63 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  36.67 
 
 		 252 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1594  NAD-dependent deacetylase  37.07 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000756784  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  41.39 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  32.75 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0479  Silent information regulator protein Sir2  39.58 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441924 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  34.07 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  34.44 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  39.58 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  35.17 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  34.19 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  40.61 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  36.22 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  38.13 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  34.76 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  38.61 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  39.61 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  39.92 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  41.1 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  38.96 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  38.96 
 
 		 237 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  38.96 
 
 		 237 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  40.98 
 
 		 260 aa  131  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2682  Silent information regulator protein Sir2  36.36 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  35.19 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  32.22 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  36.97 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  38.89 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  37.72 
 
 		 264 aa  128  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 255 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  40.8 
 
 		 226 aa  128  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  35.71 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  37.04 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  37.25 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  38.31 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  34.91 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  35.9 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  34.32 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  33.48 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  35.1 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  37.34 
 
 		 249 aa  125  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  38.5 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  35.71 
 
 		 248 aa  125  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  36.97 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  36.64 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  35.93 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  33.19 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  39.22 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  36.84 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  38.83 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  31.98 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  34.29 
 
 		 253 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  35.19 
 
 		 243 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  39.9 
 
 		 232 aa  122  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  35.19 
 
 		 243 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  35.06 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  31.28 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>