133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2898 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2898  integral membrane protein  100 
 
 		 279 aa  570  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345638  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  63.44 
 
 		 280 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  64.29 
 
 		 280 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  60.44 
 
 		 277 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  45.99 
 
 		 278 aa  242  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  45.99 
 
 		 278 aa  242  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  44.93 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  46.38 
 
 		 277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  45.26 
 
 		 277 aa  229  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  45.1 
 
 		 259 aa  218  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  41.24 
 
 		 279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3712  rhomboid family protein  41.79 
 
 		 278 aa  209  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  39.93 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  39.78 
 
 		 276 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0062  rhomboid family protein  40.81 
 
 		 278 aa  202  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.015636  hitchhiker  0.000000313005 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  40.14 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  40.14 
 
 		 276 aa  200  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  40.14 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  40.14 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  40.14 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  40.14 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  40.14 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  40.14 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0098  rhomboid family protein  39.78 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.351068  hitchhiker  0.00489186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  40.14 
 
 		 276 aa  198  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4671  glpG protein  40.73 
 
 		 280 aa  198  7e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3618  rhomboid-like protein  41.39 
 
 		 280 aa  198  9e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000228786  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0055  rhomboid family protein  39.42 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000850289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4483  rhomboid family protein  39.42 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141048  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4288  Rhomboid family protein  39.42 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0527453  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3904  rhomboid family protein  38.6 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00422303  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4343  rhomboid family protein  39.05 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172668  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3941  rhomboid family protein  40.07 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000502611  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3903  rhomboid family protein  39.35 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000174103  normal  0.392188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3995  rhomboid family protein  39.35 
 
 		 280 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.0215487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4107  rhomboid family protein  39.71 
 
 		 280 aa  195  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000304779  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  38.68 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  37.14 
 
 		 276 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  37.14 
 
 		 276 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  37.14 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  37.18 
 
 		 274 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  37.18 
 
 		 274 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0095  glpG protein  40.51 
 
 		 276 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000920194  normal  0.0164253 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0123  putative glpG protein  38.18 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0230  intramembrane serine protease GlpG  40.58 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  37.28 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00069  putative glpG protein  35.99 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  34 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1574  rhomboid family protein  31.93 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2014  rhomboid family protein  32.28 
 
 		 295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1546  rhomboid family protein  31.69 
 
 		 295 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3728  rhomboid family protein  31.58 
 
 		 295 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  42.47 
 
 		 224 aa  102  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2164  rhomboid family protein  41.43 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2197  rhomboid-like protein  27.97 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 340 aa  95.9  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  27.05 
 
 		 293 aa  95.9  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3791  rhomboid family protein  29.47 
 
 		 284 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1687  rhomboid-like protein  28.87 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205514  normal  0.563357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2052  hypothetical protein  33.98 
 
 		 286 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00391881  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1309  rhomboid-like protein  38.41 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24240  hypothetical protein  32.93 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00172141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34050  Rhomboid family membrane protease  37.24 
 
 		 281 aa  82  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2942  rhomboid family protein  32.97 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00975184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  32.06 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  31.72 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  31.03 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  25.22 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  32.33 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  28.03 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  24.59 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3276  Rhomboid family protein  33.81 
 
 		 430 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1033  rhomboid-like protein  25.13 
 
 		 198 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  29.89 
 
 		 200 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  27.12 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  27.4 
 
 		 234 aa  53.1  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  27.39 
 
 		 486 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1360  Rhomboid family protein  29.03 
 
 		 492 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165337  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  27.68 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  32.65 
 
 		 292 aa  50.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  23.33 
 
 		 238 aa  49.7  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1853  Rhomboid family protein  25.52 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0140086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  30.15 
 
 		 303 aa  48.9  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2053  Rhomboid family protein  25.47 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  26.62 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  26.62 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  26.62 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  30.71 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  31.02 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  26.95 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  32.59 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  29.69 
 
 		 190 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  30.22 
 
 		 356 aa  46.6  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  26.52 
 
 		 298 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  24.17 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  23.11 
 
 		 234 aa  46.2  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  25.16 
 
 		 303 aa  45.8  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  25.68 
 
 		 271 aa  45.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  28.47 
 
 		 336 aa  45.8  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  26.28 
 
 		 487 aa  45.8  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>