87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1033 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1033  rhomboid-like protein  100 
 
 		 198 aa  364  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1093  Rhomboid family protein  86.87 
 
 		 198 aa  290  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1085  Rhomboid family protein  80.85 
 
 		 204 aa  268  5e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1467  hypothetical protein  33.86 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0800  rhomboid family protein  41.03 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2350  rhomboid family protein  29.61 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0538538  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2898  integral membrane protein  25.13 
 
 		 279 aa  53.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345638  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  34.74 
 
 		 303 aa  51.6  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4990  peptidase S54-type, rhomboid-like protein  36.36 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25145  normal  0.208438 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0230  membrane protein, rhomboid family  32.61 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1088  integral membrane protein  28.33 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  37.1 
 
 		 279 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02194  membrane protein, Rhomboid family  27.16 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 340 aa  48.5  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  30.34 
 
 		 277 aa  48.5  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  40.45 
 
 		 290 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  33.86 
 
 		 292 aa  48.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0888  rhomboid family protein  23.9 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.86404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  32.58 
 
 		 271 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  29.21 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0169  Rhomboid family protein  32.52 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2063  rhomboid family protein  32.21 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2148  rhomboid family membrane protein  24.78 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  31.2 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  34.44 
 
 		 276 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  34.44 
 
 		 276 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  34.44 
 
 		 276 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  34.44 
 
 		 276 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2047  rhomboid family protein  30.19 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285623  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  27.4 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  34.44 
 
 		 276 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  34.44 
 
 		 276 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  34.44 
 
 		 276 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  34.44 
 
 		 276 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  34.44 
 
 		 276 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  36 
 
 		 369 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2522  rhomboid family membrane protein  27.08 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  34.44 
 
 		 306 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  35.2 
 
 		 238 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  33.33 
 
 		 277 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2197  rhomboid-like protein  33.68 
 
 		 289 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  33.61 
 
 		 371 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  32.58 
 
 		 277 aa  45.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  43.68 
 
 		 360 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  27.18 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  27.18 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  32.46 
 
 		 356 aa  45.1  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  31.91 
 
 		 274 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  31.91 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  31.91 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1567  hypothetical protein  30.6 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.018833  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  31.91 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  31.91 
 
 		 274 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2114  rhomboid family protein  29.73 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343017  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  38.67 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0095  glpG protein  32.22 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000920194  normal  0.0164253 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  26.47 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  42.53 
 
 		 360 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  26.47 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  30.38 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  32.22 
 
 		 276 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3941  rhomboid family protein  32.22 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000502611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2553  rhomboid family protein  27.47 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0621154  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  42.53 
 
 		 360 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0810  Rhomboid family protein  28.89 
 
 		 258 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  33.97 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1875  rhomboid family protein  26.92 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.413109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2270  Rhomboid family protein  29.73 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00653341  normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4542  hypothetical protein  29.73 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3712  rhomboid family protein  31.96 
 
 		 278 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4671  glpG protein  34.09 
 
 		 280 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  26.71 
 
 		 280 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  25.24 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2160  rhomboid family protein  28.83 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1574  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 292 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  28.21 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3903  rhomboid family protein  32.95 
 
 		 280 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000174103  normal  0.392188 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  30 
 
 		 259 aa  42  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2060  rhomboid family protein  30.11 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4107  rhomboid family protein  32.95 
 
 		 280 aa  42  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000304779  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  30 
 
 		 278 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  30 
 
 		 278 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2256  rhomboid family protein  30.43 
 
 		 187 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.18089  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  26.81 
 
 		 293 aa  41.6  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3995  rhomboid family protein  32.95 
 
 		 280 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.0215487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  29.09 
 
 		 327 aa  41.2  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  26.92 
 
 		 190 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>