44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0169 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0169  Rhomboid family protein  100 
 
 		 187 aa  360  7.0000000000000005e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0230  membrane protein, rhomboid family  48.78 
 
 		 193 aa  110  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1088  integral membrane protein  41.94 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0888  rhomboid family protein  38 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.86404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2522  rhomboid family membrane protein  34.64 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004038  membrane protein  40.65 
 
 		 183 aa  90.9  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.03896  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2350  rhomboid family protein  34.78 
 
 		 200 aa  90.9  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0538538  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02194  membrane protein, Rhomboid family  41.29 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2504  hypothetical protein  41.25 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2148  rhomboid family membrane protein  37.43 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2553  rhomboid family protein  35.54 
 
 		 202 aa  85.1  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0621154  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2060  rhomboid family protein  38.67 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1915  rhomboid family protein  36.61 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2165  rhomboid family protein  36.61 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1853  rhomboid family protein  36.54 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124866  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2016  rhomboid-like protein  34.42 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01423  hypothetical protein  39.86 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2160  rhomboid family protein  37.18 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2047  rhomboid family protein  36.94 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285623  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2063  rhomboid family protein  32.98 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2256  rhomboid family protein  36.54 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.18089  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2114  rhomboid family protein  36.54 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2270  Rhomboid family protein  36.54 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00653341  normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4542  hypothetical protein  36.54 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1827  hypothetical protein  38.51 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.545159  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1875  rhomboid family protein  33.55 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.413109  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1567  hypothetical protein  38.85 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.018833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1033  rhomboid-like protein  32.52 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3112  rhomboid family protein  37.89 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1085  Rhomboid family protein  31.72 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2486  hypothetical protein  34.91 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2892  putative transmembrane protein  35.26 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0995  hypothetical protein  43.01 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0244119  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3691  hypothetical protein  30.54 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  32.31 
 
 		 287 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1093  Rhomboid family protein  31.72 
 
 		 198 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0800  rhomboid family protein  38.66 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  36.9 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  27.03 
 
 		 342 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4990  peptidase S54-type, rhomboid-like protein  32.58 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25145  normal  0.208438 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2655  hypothetical protein  34.62 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  29.03 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  26.35 
 
 		 342 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  28.24 
 
 		 292 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>