64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2350 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2350  rhomboid family protein  100 
 
 		 200 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0538538  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1915  rhomboid family protein  57.71 
 
 		 205 aa  227  8e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2270  Rhomboid family protein  59.69 
 
 		 198 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00653341  normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2060  rhomboid family protein  60 
 
 		 204 aa  225  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283359  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2504  hypothetical protein  61.96 
 
 		 204 aa  225  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4542  hypothetical protein  59.18 
 
 		 198 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2165  rhomboid family protein  60 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2114  rhomboid family protein  63.13 
 
 		 198 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2553  rhomboid family protein  54 
 
 		 202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0621154  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2160  rhomboid family protein  58.67 
 
 		 198 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1853  rhomboid family protein  68.63 
 
 		 188 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124866  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2256  rhomboid family protein  62.94 
 
 		 187 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.18089  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2063  rhomboid family protein  63.74 
 
 		 194 aa  201  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2047  rhomboid family protein  61.63 
 
 		 171 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285623  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1875  rhomboid family protein  58.33 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.413109  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2016  rhomboid-like protein  48.34 
 
 		 218 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1827  hypothetical protein  57.93 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.545159  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02194  membrane protein, Rhomboid family  46.25 
 
 		 194 aa  144  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2148  rhomboid family membrane protein  44.32 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01423  hypothetical protein  42.76 
 
 		 162 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2522  rhomboid family membrane protein  40 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1567  hypothetical protein  48.48 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.018833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1088  integral membrane protein  45.89 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004038  membrane protein  37.5 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.03896  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0888  rhomboid family protein  43.59 
 
 		 186 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.86404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0230  membrane protein, rhomboid family  40.67 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0169  Rhomboid family protein  34.78 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3112  rhomboid family protein  36.57 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1033  rhomboid-like protein  29.61 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1467  hypothetical protein  28.49 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2655  hypothetical protein  33.14 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2892  putative transmembrane protein  30.56 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2486  hypothetical protein  32.26 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1085  Rhomboid family protein  28.25 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  24.61 
 
 		 519 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  26.39 
 
 		 342 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 579 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0917  rhomboid family protein  29.1 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  29.02 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  28.16 
 
 		 554 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0800  rhomboid family protein  29.91 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  30.25 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1093  Rhomboid family protein  27.78 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  30.34 
 
 		 513 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  25.69 
 
 		 342 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  40 
 
 		 371 aa  45.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  25.62 
 
 		 286 aa  45.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  30.07 
 
 		 279 aa  45.4  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3904  rhomboid family protein  26.76 
 
 		 281 aa  45.1  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00422303  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3903  rhomboid family protein  26.06 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000174103  normal  0.392188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3995  rhomboid family protein  26.06 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.0215487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4107  rhomboid family protein  26.06 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000304779  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  26.89 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  25.9 
 
 		 289 aa  43.1  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  27.61 
 
 		 291 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4671  glpG protein  26.06 
 
 		 280 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  27.07 
 
 		 280 aa  42.4  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0055  rhomboid family protein  24.73 
 
 		 281 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000850289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4343  rhomboid family protein  24.73 
 
 		 281 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172668  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  27.46 
 
 		 280 aa  41.6  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  26.74 
 
 		 523 aa  41.6  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4483  rhomboid family protein  24.73 
 
 		 281 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141048  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4288  Rhomboid family protein  24.73 
 
 		 281 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0527453  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>