32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0995 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0995  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0244119  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2486  hypothetical protein  60.54 
 
 		 204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2892  putative transmembrane protein  61.08 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1031  transmembrane protein  71.43 
 
 		 192 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281068  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2655  hypothetical protein  59.12 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02194  membrane protein, Rhomboid family  34.48 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1915  rhomboid family protein  29.44 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2165  rhomboid family protein  28.93 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2060  rhomboid family protein  28.93 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0169  Rhomboid family protein  43.01 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2504  hypothetical protein  32.11 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1467  hypothetical protein  29.12 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0230  membrane protein, rhomboid family  39.77 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1853  rhomboid family protein  31.21 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124866  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2350  rhomboid family protein  30.67 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0538538  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0888  rhomboid family protein  26.06 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.86404 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2270  Rhomboid family protein  31.21 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00653341  normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4542  hypothetical protein  31.21 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2256  rhomboid family protein  31.21 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.18089  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2114  rhomboid family protein  31.21 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343017  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2160  rhomboid family protein  31.21 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2016  rhomboid-like protein  26.4 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3691  hypothetical protein  33.75 
 
 		 237 aa  45.1  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  26.27 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  26.27 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  26.27 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  26.27 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  26.27 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2522  rhomboid family membrane protein  29.36 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1088  integral membrane protein  28.57 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3112  rhomboid family protein  34.97 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0241  hypothetical protein  34.06 
 
 		 190 aa  41.6  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>