13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0241 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0241  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  348  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3518  hypothetical protein  52.82 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267741 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2892  putative transmembrane protein  33.12 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2486  hypothetical protein  31.61 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2655  hypothetical protein  34.9 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0800  rhomboid family protein  32.96 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02194  membrane protein, Rhomboid family  31.28 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0888  rhomboid family protein  27.4 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.86404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0230  membrane protein, rhomboid family  33.12 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2553  rhomboid family protein  28.49 
 
 		 202 aa  42  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0621154  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1033  rhomboid-like protein  34.97 
 
 		 198 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1875  rhomboid family protein  28.74 
 
 		 209 aa  41.6  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.413109  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1467  hypothetical protein  33.04 
 
 		 211 aa  41.2  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>