More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05309 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  100 
 
 		 181 aa  377  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  79.01 
 
 		 181 aa  289  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  51.55 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  49.42 
 
 		 182 aa  181  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  49.71 
 
 		 203 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  49.71 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  47.7 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  49.13 
 
 		 203 aa  177  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  47.13 
 
 		 230 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  47.51 
 
 		 177 aa  177  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  47.13 
 
 		 230 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  47.13 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  48.45 
 
 		 184 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  48.45 
 
 		 184 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  46.24 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  45.35 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  47.93 
 
 		 183 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  46.24 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  46.24 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  46.24 
 
 		 183 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  45.4 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  50 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  46.75 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  48.05 
 
 		 192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  45.96 
 
 		 176 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  47.5 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  47.85 
 
 		 183 aa  160  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  48.41 
 
 		 202 aa  160  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  44.25 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  52.17 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  43.21 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  45.56 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  44.91 
 
 		 190 aa  155  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  47.2 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  43.67 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  46.75 
 
 		 193 aa  154  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  45.68 
 
 		 185 aa  154  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  44.94 
 
 		 189 aa  153  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  45.57 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  43.75 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  43.31 
 
 		 233 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  50 
 
 		 195 aa  148  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  45.77 
 
 		 195 aa  148  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  46.62 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  41.71 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  43.67 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  49.64 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00580  glutathione peroxidase, putative  50.69 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256439  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  41.88 
 
 		 199 aa  137  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  36.81 
 
 		 191 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  47.48 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  46.81 
 
 		 165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  41.61 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  44.93 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  46.62 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  48.06 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  45.65 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  46.58 
 
 		 163 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  46.1 
 
 		 158 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  48.65 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  44.87 
 
 		 161 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  42.45 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  47.97 
 
 		 161 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  48.92 
 
 		 161 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  46.72 
 
 		 163 aa  130  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  45.65 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  47.45 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  47.86 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  47.97 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78456  glutathione peroxidase  47.14 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.437317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  43.36 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  44.6 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  44.78 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  45.65 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  46.76 
 
 		 160 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  46.76 
 
 		 160 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  45.32 
 
 		 158 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  44.78 
 
 		 159 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  45.71 
 
 		 161 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  46.72 
 
 		 160 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  45.67 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3995  Peroxiredoxin  46.43 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  44.85 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  44.85 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  46.04 
 
 		 160 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  46.04 
 
 		 160 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  46.04 
 
 		 160 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  46.46 
 
 		 164 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  46.72 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0872  glutathione peroxidase  45.99 
 
 		 158 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  46.04 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  46.43 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  46.72 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02846  phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase (Eurofung)  49.24 
 
 		 282 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.440988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  46.04 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  44.96 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  46.51 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  41.03 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  45.33 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>