More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000816 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000816  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 690 aa  1416    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06723  histidine kinase  84.11 
 
 		 686 aa  1137    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1136  putative C4-dicarboxylate transport sensor protein  53.37 
 
 		 684 aa  687    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00183456  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2874  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 693 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266107 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  40.22 
 
 		 659 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  38.58 
 
 		 616 aa  178  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0914  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 771 aa  177  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 591 aa  177  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 683 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 672 aa  173  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  37.41 
 
 		 666 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  38.91 
 
 		 665 aa  171  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  40 
 
 		 585 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 585 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 585 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 585 aa  168  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  38.37 
 
 		 670 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  36.69 
 
 		 666 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  32.08 
 
 		 588 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 604 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  32.94 
 
 		 586 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 668 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2129  sensor histidine kinase  37.28 
 
 		 587 aa  162  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178359  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 604 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 630 aa  161  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.941233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  38.33 
 
 		 585 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 586 aa  160  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1462  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 600 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0277816  normal  0.69414 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 585 aa  159  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572324  normal  0.76853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18010  C4-dicarboylate transport sensory histidine protein kinase, two-component; DctB  38.02 
 
 		 592 aa  158  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892386  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 588 aa  158  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206032  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 623 aa  157  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 621 aa  156  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 634 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 672 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 634 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  31.98 
 
 		 669 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 637 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 677 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 634 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 669 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 669 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  32.4 
 
 		 677 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  37.74 
 
 		 602 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  32.4 
 
 		 677 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  34.98 
 
 		 627 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 638 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 631 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  35.16 
 
 		 630 aa  154  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 635 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  36.08 
 
 		 615 aa  154  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  31.69 
 
 		 669 aa  154  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 607 aa  153  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 628 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 597 aa  152  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0801303  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  31.12 
 
 		 626 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 598 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 634 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 598 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 598 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  34.27 
 
 		 598 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  34.94 
 
 		 603 aa  151  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4291  sensor histidine kinase  36.25 
 
 		 585 aa  151  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  37.2 
 
 		 600 aa  151  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  32.85 
 
 		 668 aa  150  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 634 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 627 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  32.4 
 
 		 677 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 603 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 603 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 603 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  34.29 
 
 		 611 aa  148  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  35.99 
 
 		 677 aa  148  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 604 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 635 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 652 aa  147  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  34.88 
 
 		 626 aa  147  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  35.08 
 
 		 594 aa  147  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  36.4 
 
 		 623 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  34.88 
 
 		 621 aa  146  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 627 aa  146  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  38.52 
 
 		 604 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  34.5 
 
 		 621 aa  146  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  34.57 
 
 		 635 aa  145  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  33.45 
 
 		 643 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  34.93 
 
 		 635 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  33.53 
 
 		 597 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  36.96 
 
 		 604 aa  144  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3242  phosphoglycerate transport regulator  30.13 
 
 		 787 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 602 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 587 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  32.51 
 
 		 618 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  30.95 
 
 		 633 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  35.12 
 
 		 612 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5344  histidine kinase  38.4 
 
 		 611 aa  141  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  34.71 
 
 		 599 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  35.74 
 
 		 622 aa  140  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 622 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  38.29 
 
 		 590 aa  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2718  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 598 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>