More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1264 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 308 aa  635    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  77.6 
 
 		 308 aa  508  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  77.92 
 
 		 308 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  64.03 
 
 		 335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  63.16 
 
 		 322 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  62.09 
 
 		 327 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  61.18 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  61.51 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  60.73 
 
 		 346 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  61.18 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  61.26 
 
 		 346 aa  388  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  61.18 
 
 		 318 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  60.53 
 
 		 317 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  61.13 
 
 		 346 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  61.11 
 
 		 323 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  56.48 
 
 		 340 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  59.41 
 
 		 323 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.13 
 
 		 322 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  58.5 
 
 		 313 aa  358  6e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  52.41 
 
 		 315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  45.61 
 
 		 316 aa  268  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  43.73 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  45.54 
 
 		 314 aa  263  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  43.42 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  43.19 
 
 		 350 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  44.01 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  43.14 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  41.8 
 
 		 324 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  40.72 
 
 		 314 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  42.81 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  47.37 
 
 		 270 aa  244  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  44.85 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  43.88 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  47.35 
 
 		 304 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  42.95 
 
 		 319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  42.76 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  40.92 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  41.37 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  41.75 
 
 		 319 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  42.24 
 
 		 315 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  43.23 
 
 		 312 aa  238  6.999999999999999e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  39.81 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  45.28 
 
 		 510 aa  236  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  40.8 
 
 		 323 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  41.53 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  42.86 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  41.72 
 
 		 323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  41.61 
 
 		 322 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  40.76 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  39.62 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  41.86 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.81 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  39.49 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  40.33 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  47.6 
 
 		 257 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  40.33 
 
 		 313 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  40.91 
 
 		 317 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  40.26 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  43.62 
 
 		 247 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  39.6 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  45.81 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  38.41 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  41.35 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  45.7 
 
 		 512 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 		 315 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  40.07 
 
 		 317 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  40.58 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  44.1 
 
 		 909 aa  223  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  46.4 
 
 		 593 aa  223  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  46.61 
 
 		 590 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  46.15 
 
 		 590 aa  222  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  45.54 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  40.58 
 
 		 322 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  45.25 
 
 		 594 aa  219  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  43.72 
 
 		 921 aa  220  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1514  ABC transporter related  47.72 
 
 		 205 aa  219  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  38.44 
 
 		 307 aa  218  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  46.43 
 
 		 932 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  43.64 
 
 		 248 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  38.41 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  42.97 
 
 		 578 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.07 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  44.35 
 
 		 904 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  40.77 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  39.48 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  38.82 
 
 		 308 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  37.87 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  38.18 
 
 		 308 aa  215  7e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1292  ABC transporter, ATP binding/permease protein  37.67 
 
 		 315 aa  215  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.549706  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  45.91 
 
 		 582 aa  215  7e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  39.46 
 
 		 322 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0719  hypothetical protein  38.18 
 
 		 308 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  41.86 
 
 		 331 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  43.91 
 
 		 667 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  45.09 
 
 		 583 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 		 580 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  40 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>