More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2073 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  57.5 
 
 		 597 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 627 aa  1286    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  43.91 
 
 		 557 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  43.07 
 
 		 559 aa  465  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 		 531 aa  344  2.9999999999999997e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  36.47 
 
 		 557 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  37.74 
 
 		 551 aa  337  5e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  33.97 
 
 		 567 aa  319  7.999999999999999e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  34.71 
 
 		 545 aa  319  7.999999999999999e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  33.76 
 
 		 548 aa  316  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  33.39 
 
 		 548 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  35.73 
 
 		 556 aa  312  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  35.19 
 
 		 547 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  34.08 
 
 		 560 aa  303  7.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  33.89 
 
 		 560 aa  296  7e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  33.4 
 
 		 551 aa  294  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  34.03 
 
 		 569 aa  290  7e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  33.39 
 
 		 565 aa  287  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  35.87 
 
 		 567 aa  286  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  34.21 
 
 		 554 aa  282  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 		 579 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  31.92 
 
 		 562 aa  270  5.9999999999999995e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  33.07 
 
 		 540 aa  265  2e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  31.4 
 
 		 553 aa  262  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  32.81 
 
 		 576 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  32.25 
 
 		 565 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.82 
 
 		 552 aa  251  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  32.85 
 
 		 609 aa  247  4.9999999999999997e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  31.93 
 
 		 561 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  33.27 
 
 		 568 aa  242  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 		 604 aa  233  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  31.46 
 
 		 604 aa  229  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.89 
 
 		 563 aa  228  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  31.17 
 
 		 560 aa  227  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.31 
 
 		 564 aa  226  9e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 557 aa  207  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 557 aa  207  6e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  32.1 
 
 		 559 aa  206  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  31.72 
 
 		 572 aa  204  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  28.7 
 
 		 645 aa  196  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.45 
 
 		 563 aa  194  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0901  extracellular solute-binding protein family 5  30.53 
 
 		 675 aa  194  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  28.2 
 
 		 580 aa  190  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 576 aa  187  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.38 
 
 		 609 aa  187  5e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 636 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 568 aa  181  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  29.94 
 
 		 587 aa  167  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  29.12 
 
 		 605 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  27.1 
 
 		 562 aa  154  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 564 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 544 aa  152  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  27.69 
 
 		 523 aa  150  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.89 
 
 		 512 aa  148  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 510 aa  146  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  27.36 
 
 		 631 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 510 aa  145  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 544 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.44 
 
 		 505 aa  144  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  27.77 
 
 		 536 aa  144  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0734  extracellular solute-binding protein family 5  26.58 
 
 		 594 aa  141  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.52 
 
 		 524 aa  142  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 534 aa  141  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  28.48 
 
 		 537 aa  141  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 559 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  31.4 
 
 		 629 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  26.83 
 
 		 577 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 557 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  28.38 
 
 		 522 aa  138  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.23 
 
 		 588 aa  138  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.09 
 
 		 565 aa  136  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.41 
 
 		 532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  27.93 
 
 		 516 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3196  extracellular solute-binding protein family 5  25.69 
 
 		 600 aa  135  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000171923  unclonable  0.0000000000413572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  26.21 
 
 		 519 aa  134  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 511 aa  134  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  27.73 
 
 		 533 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.54 
 
 		 510 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  27.99 
 
 		 534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3466  extracellular solute-binding protein family 5  28.2 
 
 		 596 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0853012  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  25.49 
 
 		 553 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 531 aa  132  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 515 aa  131  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.01 
 
 		 527 aa  131  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 575 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.61 
 
 		 542 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  28.02 
 
 		 536 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 		 527 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.49 
 
 		 587 aa  130  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.49 
 
 		 535 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  25.97 
 
 		 502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.33 
 
 		 546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  26.18 
 
 		 566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  26.96 
 
 		 551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 522 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.13 
 
 		 542 aa  128  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>