More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1246 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1246  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 551 aa  1123    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1786  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  28.19 
 
 		 501 aa  160  8e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1829  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  28.19 
 
 		 501 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181127  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2773  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.19 
 
 		 500 aa  151  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.643007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2645  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.89 
 
 		 508 aa  150  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.260435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1785  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.13 
 
 		 505 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0257213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1828  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.13 
 
 		 505 aa  146  9e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.338904  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2772  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.65 
 
 		 507 aa  143  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0734  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.46 
 
 		 516 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.013522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0735  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.6 
 
 		 496 aa  134  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1585  DNA mismatch repair protein MutS-like  31.35 
 
 		 547 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2646  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.04 
 
 		 524 aa  103  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264695  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0342  MutS family DNA mismatch repair protein  31.86 
 
 		 536 aa  98.2  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2282  DNA mismatch repair protein MutS-like  30.54 
 
 		 547 aa  95.9  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  28.35 
 
 		 882 aa  93.6  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1737  DNA mismatch repair protein MutS  28.28 
 
 		 913 aa  90.9  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0169322  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  31.09 
 
 		 848 aa  90.5  7e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  25.13 
 
 		 855 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  25.13 
 
 		 855 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  28.36 
 
 		 867 aa  89.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  28.28 
 
 		 881 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  29.47 
 
 		 860 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  32.35 
 
 		 875 aa  88.2  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  27.3 
 
 		 855 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  30.77 
 
 		 865 aa  87.4  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  26.27 
 
 		 868 aa  87.8  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  32.65 
 
 		 868 aa  87.4  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  26.97 
 
 		 859 aa  87  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  25.07 
 
 		 855 aa  87  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  31.64 
 
 		 968 aa  86.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  26.64 
 
 		 860 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 878 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  31 
 
 		 863 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  28.39 
 
 		 887 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18351  DNA mismatch repair protein MutS  32.04 
 
 		 913 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  28.64 
 
 		 857 aa  85.9  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18351  DNA mismatch repair protein MutS  28.79 
 
 		 914 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  31.61 
 
 		 917 aa  85.1  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18541  DNA mismatch repair protein MutS  27.8 
 
 		 913 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  32.16 
 
 		 828 aa  85.1  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  31.09 
 
 		 918 aa  85.1  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  29.62 
 
 		 872 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  29.8 
 
 		 750 aa  84.7  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  35.04 
 
 		 871 aa  84.7  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0119  DNA mismatch repair protein MutS  30.37 
 
 		 931 aa  84.7  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.893903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  29.47 
 
 		 853 aa  84.3  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  28.94 
 
 		 893 aa  84.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  30.48 
 
 		 896 aa  84.3  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  30.19 
 
 		 867 aa  84.3  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  28.08 
 
 		 903 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  33.82 
 
 		 882 aa  83.6  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  27.17 
 
 		 857 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  27.17 
 
 		 857 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  32.47 
 
 		 898 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  31.22 
 
 		 871 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  32.83 
 
 		 872 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  32.64 
 
 		 880 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  29.8 
 
 		 872 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  34.53 
 
 		 873 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00881  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 927 aa  82  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0543692 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  33.57 
 
 		 910 aa  82  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  33.57 
 
 		 910 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  29.35 
 
 		 891 aa  81.3  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  29.95 
 
 		 880 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2017  DNA mismatch repair protein MutS  31.09 
 
 		 1014 aa  80.9  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  29.44 
 
 		 857 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  24.21 
 
 		 888 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  27.96 
 
 		 870 aa  80.9  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  30.05 
 
 		 865 aa  80.5  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  30.1 
 
 		 858 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  30.46 
 
 		 881 aa  79.7  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  29.38 
 
 		 956 aa  79  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  26.86 
 
 		 870 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  26.86 
 
 		 870 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3224  DNA mismatch repair protein MutS  29.84 
 
 		 895 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  33.57 
 
 		 862 aa  79  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0273  DNA mismatch repair protein MutS  32.2 
 
 		 1040 aa  79.3  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.601662 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  35.04 
 
 		 872 aa  78.6  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  29.69 
 
 		 761 aa  78.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  31.63 
 
 		 905 aa  78.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  24.3 
 
 		 888 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_52173  muts-like protein 5  25.11 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  31.49 
 
 		 862 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  33.79 
 
 		 894 aa  77.8  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  27.13 
 
 		 904 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  30 
 
 		 859 aa  78.2  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  33.09 
 
 		 859 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21131  DNA mismatch repair protein MutS  29.49 
 
 		 926 aa  78.2  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0652427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0247  DNA mismatch repair protein MutS  30.61 
 
 		 1058 aa  77.4  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34085  predicted protein  24.69 
 
 		 1007 aa  77.8  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.297969  normal  0.623648 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  27.42 
 
 		 793 aa  77.8  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  28.91 
 
 		 872 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  32.35 
 
 		 856 aa  77.8  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  26 
 
 		 939 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  26.39 
 
 		 930 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 868 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  26 
 
 		 939 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  26 
 
 		 939 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  26 
 
 		 939 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01536  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 		 851 aa  77.4  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>