More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1020 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  100 
 
 
420 aa  851    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  34.57 
 
 
430 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  32.99 
 
 
430 aa  219  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  34.73 
 
 
416 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  33.77 
 
 
444 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  32.72 
 
 
412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  29.87 
 
 
416 aa  196  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  30.73 
 
 
419 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  30 
 
 
417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  29.61 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  31.56 
 
 
419 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  29.32 
 
 
390 aa  163  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  27.66 
 
 
391 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  28.17 
 
 
412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  27.14 
 
 
373 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  27.12 
 
 
392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.24 
 
 
381 aa  133  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  27.14 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  27.13 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.97 
 
 
377 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  26.24 
 
 
397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  26.65 
 
 
376 aa  127  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  27.08 
 
 
389 aa  126  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.56 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  26.16 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.45 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  30.12 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  30.12 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.46 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.69 
 
 
381 aa  117  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  29.12 
 
 
537 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  25.69 
 
 
406 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  28.72 
 
 
400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  22.25 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  30.13 
 
 
397 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  28.21 
 
 
389 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  27.27 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  25.44 
 
 
402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  26.24 
 
 
373 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.61 
 
 
423 aa  110  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  26.24 
 
 
402 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  25.95 
 
 
402 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.69 
 
 
398 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  25.95 
 
 
402 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  30.23 
 
 
414 aa  107  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.42 
 
 
398 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  25.15 
 
 
397 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  31.53 
 
 
395 aa  106  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  29.6 
 
 
402 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  29.6 
 
 
402 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  29.25 
 
 
402 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  25.55 
 
 
580 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  27.24 
 
 
402 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  27.24 
 
 
402 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.82 
 
 
382 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  26.42 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  27.49 
 
 
402 aa  97.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  26.25 
 
 
414 aa  96.3  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  25.09 
 
 
428 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  24.81 
 
 
400 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  27.73 
 
 
428 aa  94.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  30.36 
 
 
271 aa  94  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  30.36 
 
 
274 aa  94  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2490  Septum formation inhibitor-activating ATPase- like protein  24.91 
 
 
416 aa  93.2  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  28.08 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  26.25 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  25.87 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  26.83 
 
 
413 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  24.41 
 
 
402 aa  90.1  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  25.87 
 
 
414 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.88 
 
 
399 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  27.62 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  26.92 
 
 
414 aa  89  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  26.8 
 
 
265 aa  87.8  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  24.14 
 
 
397 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.91 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  26.48 
 
 
528 aa  87  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3409  septum site-determining protein MinD  28.16 
 
 
270 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224611  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  24.52 
 
 
422 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  25.77 
 
 
428 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  24.44 
 
 
404 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1550  septum site-determining protein MinD  26.94 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.300295  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  25.75 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1558  septum site-determining protein MinD  27.76 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.859979  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  24.63 
 
 
587 aa  83.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.13 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  23.75 
 
 
423 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  25.82 
 
 
435 aa  83.2  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  24.14 
 
 
421 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  25.59 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0995  ATPase, putative  25.61 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179422  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  24.11 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  23.64 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14190  septum site-determining protein MinD  26.4 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000320626  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1763  septum site-determining protein MinD  25.75 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000014274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3163  septum site-determining protein MinD  28.27 
 
 
265 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  23.88 
 
 
423 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  27.84 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4540  septum site-determining protein MinD  28.27 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4182  septum site-determining protein; cell division inhibitor  28.27 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>