More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0898 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  59.22 
 
 		 708 aa  852    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  67.19 
 
 		 717 aa  1000    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 722 aa  1474    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  96.81 
 
 		 721 aa  1414    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  66.1 
 
 		 714 aa  990    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  60.53 
 
 		 701 aa  879    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  52.65 
 
 		 814 aa  749    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  40.99 
 
 		 793 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  40.85 
 
 		 793 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  42.97 
 
 		 755 aa  512  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.52 
 
 		 755 aa  489  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.47 
 
 		 749 aa  489  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.47 
 
 		 758 aa  488  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.78 
 
 		 757 aa  477  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  39.67 
 
 		 762 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  37.83 
 
 		 750 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.64 
 
 		 777 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  37.69 
 
 		 747 aa  432  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  38.44 
 
 		 740 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  37.15 
 
 		 800 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.01 
 
 		 750 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.62 
 
 		 780 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.78 
 
 		 790 aa  414  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  37.12 
 
 		 760 aa  415  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  37.01 
 
 		 745 aa  416  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  35.82 
 
 		 749 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  36.81 
 
 		 757 aa  412  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.01 
 
 		 742 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  34.75 
 
 		 737 aa  400  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.89 
 
 		 734 aa  402  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  36.28 
 
 		 721 aa  399  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.3 
 
 		 748 aa  395  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.97 
 
 		 813 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.88 
 
 		 809 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.76 
 
 		 751 aa  392  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.16 
 
 		 711 aa  389  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.87 
 
 		 758 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  35.74 
 
 		 874 aa  375  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  36.46 
 
 		 741 aa  374  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.72 
 
 		 757 aa  372  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  34.9 
 
 		 738 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.2 
 
 		 746 aa  352  1e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  33.76 
 
 		 691 aa  350  4e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  34.39 
 
 		 748 aa  347  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  32.22 
 
 		 748 aa  335  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  32.61 
 
 		 733 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  32.61 
 
 		 733 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  32.38 
 
 		 733 aa  331  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  32.78 
 
 		 737 aa  330  5.0000000000000004e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  34.69 
 
 		 693 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  30.07 
 
 		 685 aa  329  9e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  32.08 
 
 		 733 aa  324  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  32.24 
 
 		 731 aa  320  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  31.57 
 
 		 733 aa  320  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  32.11 
 
 		 731 aa  319  9e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  32.24 
 
 		 922 aa  319  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  31.92 
 
 		 733 aa  318  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  31.51 
 
 		 731 aa  318  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.2 
 
 		 756 aa  317  4e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  31.92 
 
 		 733 aa  316  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.08 
 
 		 724 aa  312  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.19 
 
 		 933 aa  306  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  30.96 
 
 		 829 aa  306  6e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  32.23 
 
 		 987 aa  306  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  32.3 
 
 		 716 aa  306  7e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.16 
 
 		 1072 aa  306  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  33.24 
 
 		 751 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  33.24 
 
 		 751 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  33.1 
 
 		 751 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  32.07 
 
 		 731 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  33.15 
 
 		 779 aa  303  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  32.69 
 
 		 748 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  31.3 
 
 		 805 aa  296  7e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  31.08 
 
 		 1338 aa  296  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  32.05 
 
 		 737 aa  293  5e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.69 
 
 		 1321 aa  292  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.9 
 
 		 762 aa  290  6e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.25 
 
 		 814 aa  289  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  29.09 
 
 		 772 aa  288  2.9999999999999996e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  31.11 
 
 		 735 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  32.11 
 
 		 772 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  41.84 
 
 		 823 aa  286  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  31.02 
 
 		 778 aa  282  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  30.85 
 
 		 777 aa  282  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  30.88 
 
 		 778 aa  282  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.38 
 
 		 1158 aa  276  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.82 
 
 		 820 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.62 
 
 		 784 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  38.83 
 
 		 845 aa  271  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  40.05 
 
 		 915 aa  270  8e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  28.3 
 
 		 822 aa  269  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.69 
 
 		 760 aa  268  2e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  29.24 
 
 		 819 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.63 
 
 		 792 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  39.69 
 
 		 914 aa  265  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  30.83 
 
 		 743 aa  264  4.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.41 
 
 		 771 aa  261  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10482  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  32.06 
 
 		 868 aa  259  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.584678 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.65 
 
 		 754 aa  259  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.51 
 
 		 757 aa  256  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>