279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0120 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



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Replicon accession
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% identity
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0120  ROK family protein  100 
 
 		 350 aa  703    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0118  ROK family protein  97.43 
 
 		 350 aa  651    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0688  ROK family protein  33.89 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  29.18 
 
 		 391 aa  95.9  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  25.98 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.32 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  31.14 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  23.7 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  24.29 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  29.49 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3400  ROK family protein  25.24 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.454218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3078  ROK family protein  25.47 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.808099  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  27.27 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3376  ROK family protein  25.08 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00191545  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3153  ROK family protein  25.08 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.095994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3375  ROK family protein  25.08 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  27.66 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  27.16 
 
 		 381 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0527  ROK family protein  27.98 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  27.04 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  23.49 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0541  ROK family protein  27.98 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0625094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  25.51 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0570  ROK family protein  25.53 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3139  transcriptional regulator  27.93 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0763285  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  21.61 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3373  ROK family protein  26.7 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.553535  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  21.14 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3047  ROK family protein  23.89 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.229024  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  24.44 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  26.67 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  28.95 
 
 		 754 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  23.95 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2190  ROK family protein  28.98 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  25.07 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  22.67 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  21.49 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  22.46 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  20.41 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1876  ROK family protein  24.03 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  26.52 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1654  ROK family protein  23.95 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1663  ROK family protein  27.17 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3453  ROK family protein  25 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  24.63 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  24.68 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  24.29 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  27.46 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1669  ROK family protein  22.25 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.178321  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  23.4 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  25.11 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  29.24 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  24.68 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  24.61 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  24.42 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0549  ROK family protein  28.27 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.324047  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  24.51 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  22.28 
 
 		 416 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  24.16 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  21.96 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  23.71 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  21.79 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  36.89 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0208  NagC family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  21.16 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  22.69 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  25.11 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  24.7 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  21.58 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  28.07 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  23.48 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1594  ROK family protein  24.44 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  25.88 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08010  transcriptional regulator/sugar kinase  22.83 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.440764  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  22.27 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  24.58 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0129  transcriptional regulator/sugar kinase, xylose operon regulator  25.84 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  21.49 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  25.66 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  21.32 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  25.23 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  23.33 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  21.98 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1865  ROK family protein  26.52 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  36.89 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  24.73 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  27.51 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  24.07 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1703  NagC family Transcriptional regulator  22.98 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  23.51 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0562  ROK family protein  23.9 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  22.1 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  29.7 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  21 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1684  ROK family protein  26.52 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0731  ROK family protein  25.32 
 
 		 372 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  21.53 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0099  ROK family protein  28.81 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210815  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  25.56 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  27.35 
 
 		 397 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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