147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0688 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0688  ROK family protein  100 
 
 		 342 aa  673    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0120  ROK family protein  33.22 
 
 		 350 aa  153  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0118  ROK family protein  32.89 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  28.51 
 
 		 399 aa  90.5  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  30.43 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1663  ROK family protein  30.26 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  19.58 
 
 		 398 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  26.2 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  22.01 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.22 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  22.33 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  24.74 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1669  ROK family protein  23.45 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.178321  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  20.79 
 
 		 414 aa  69.3  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  22.73 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  24.68 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  27.75 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  25.96 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  22.98 
 
 		 410 aa  67  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  26.27 
 
 		 381 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  26.52 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  26.01 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  22.58 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3083  ROK family protein  21.26 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.048241  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  20.96 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  26.57 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  22.96 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  21.26 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  26.22 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  21.61 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  28.39 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3400  ROK family protein  24.78 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.454218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3376  ROK family protein  24.78 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00191545  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3375  ROK family protein  24.78 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3153  ROK family protein  24.78 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.095994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3139  transcriptional regulator  24.78 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0763285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0731  ROK family protein  27.39 
 
 		 372 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0549  ROK family protein  27.47 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.324047  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  23.18 
 
 		 399 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  21.83 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  28.09 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  23.63 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  18.37 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  25.11 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  17.75 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1876  ROK family protein  24 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  30.23 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  21.07 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  24.05 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3047  ROK family protein  24.44 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.229024  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  19.16 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0570  ROK family protein  26.06 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.83 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  21.21 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3078  ROK family protein  23.79 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.808099  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  20.77 
 
 		 374 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  21.66 
 
 		 417 aa  57  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  23.5 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  21.33 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  23.61 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  20.37 
 
 		 390 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  20.66 
 
 		 473 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  23.66 
 
 		 409 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  18.97 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  22.13 
 
 		 417 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2517  xylose repressor  22.82 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0778227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3373  ROK family protein  23.11 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.553535  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  22.57 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0032  ROK family protein  22.82 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0032  ROK family protein  22.82 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  20.6 
 
 		 404 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2190  ROK family protein  22.08 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  19.65 
 
 		 375 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  28.84 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  19.71 
 
 		 397 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  22.13 
 
 		 425 aa  53.5  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  19.75 
 
 		 383 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  21.08 
 
 		 429 aa  53.9  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  27.07 
 
 		 408 aa  53.5  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  21.86 
 
 		 402 aa  53.5  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  26.47 
 
 		 397 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  21.92 
 
 		 392 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0206  NagC family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 404 aa  53.1  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.520067  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  22.62 
 
 		 427 aa  53.1  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0407  ROK family protein  28.44 
 
 		 397 aa  52.8  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  20.99 
 
 		 404 aa  52.8  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2545  ROK family protein  26.93 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000020299  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1680  ROK family protein  25.94 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  20.85 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  25.84 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
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NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  19.72 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  21.05 
 
 		 420 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  21.61 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  20.68 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  20.85 
 
 		 417 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  20.91 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  20.48 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
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NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  19.92 
 
 		 448 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
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NC_013131  Caci_2491  ROK family protein  19.63 
 
 		 396 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  17.32 
 
 		 384 aa  50.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
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