More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1751 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  51.71 
 
 		 770 aa  668    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  49.29 
 
 		 769 aa  645    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  59.34 
 
 		 736 aa  753    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  49.29 
 
 		 769 aa  645    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  50 
 
 		 751 aa  649    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  100 
 
 		 738 aa  1435    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  50.14 
 
 		 1155 aa  628  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  50.95 
 
 		 738 aa  619  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  49.15 
 
 		 778 aa  595  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  50.54 
 
 		 743 aa  592  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  50.42 
 
 		 748 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  49.93 
 
 		 767 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  50.42 
 
 		 754 aa  572  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  49.93 
 
 		 767 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  49.8 
 
 		 767 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  51.42 
 
 		 727 aa  556  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  45.54 
 
 		 731 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  41.48 
 
 		 796 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  40.86 
 
 		 783 aa  413  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  38.55 
 
 		 741 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.48 
 
 		 724 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  39.92 
 
 		 773 aa  402  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  37.3 
 
 		 839 aa  386  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  38.39 
 
 		 766 aa  383  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  37.32 
 
 		 733 aa  382  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.91 
 
 		 740 aa  372  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  38.4 
 
 		 953 aa  372  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  50.78 
 
 		 500 aa  372  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  35.89 
 
 		 740 aa  365  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.88 
 
 		 1308 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  37.21 
 
 		 710 aa  350  7e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  34.12 
 
 		 741 aa  342  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  37.73 
 
 		 717 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  33.11 
 
 		 805 aa  328  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  33.7 
 
 		 758 aa  320  7e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  37.43 
 
 		 762 aa  309  9e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  34.96 
 
 		 738 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  36.16 
 
 		 731 aa  299  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.68 
 
 		 730 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.87 
 
 		 730 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.68 
 
 		 730 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  28.01 
 
 		 730 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.73 
 
 		 730 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.73 
 
 		 730 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.73 
 
 		 730 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  29.19 
 
 		 730 aa  288  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  29.19 
 
 		 730 aa  287  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  27.86 
 
 		 730 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  34.26 
 
 		 743 aa  272  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.38 
 
 		 738 aa  272  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  27.82 
 
 		 729 aa  266  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  29.18 
 
 		 1013 aa  266  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  34.56 
 
 		 846 aa  257  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  32.05 
 
 		 761 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.47 
 
 		 1095 aa  253  7e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  31.19 
 
 		 997 aa  248  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  32.24 
 
 		 717 aa  247  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  33.58 
 
 		 842 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  35.7 
 
 		 741 aa  232  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  29.48 
 
 		 743 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.38 
 
 		 740 aa  229  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  30.01 
 
 		 743 aa  229  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  33.05 
 
 		 723 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  32.43 
 
 		 758 aa  228  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  29.5 
 
 		 944 aa  228  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  32.72 
 
 		 724 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.41 
 
 		 796 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  34.38 
 
 		 737 aa  224  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  30.43 
 
 		 752 aa  223  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  33.22 
 
 		 743 aa  223  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  29.66 
 
 		 983 aa  223  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  29.66 
 
 		 983 aa  223  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  27.26 
 
 		 829 aa  223  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  27.26 
 
 		 829 aa  223  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  33.24 
 
 		 723 aa  221  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11169  transmembrane transport protein mmpL13a  43.16 
 
 		 361 aa  221  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.266542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  31.49 
 
 		 718 aa  220  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  32.72 
 
 		 757 aa  219  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  31.63 
 
 		 979 aa  218  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  29.32 
 
 		 735 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  29.56 
 
 		 718 aa  214  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  32.04 
 
 		 709 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  31.79 
 
 		 732 aa  211  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  31.45 
 
 		 978 aa  211  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  32.06 
 
 		 966 aa  210  8e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  28.98 
 
 		 758 aa  209  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  26.66 
 
 		 704 aa  209  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  33.03 
 
 		 832 aa  207  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  31.72 
 
 		 968 aa  205  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  34.5 
 
 		 732 aa  204  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  29.03 
 
 		 734 aa  204  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  28.13 
 
 		 893 aa  202  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  29.65 
 
 		 745 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  28.99 
 
 		 737 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  32.1 
 
 		 728 aa  197  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  33.46 
 
 		 731 aa  197  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.69 
 
 		 746 aa  192  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  31.41 
 
 		 793 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  32.18 
 
 		 711 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  31.25 
 
 		 734 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>